RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
MTMR1-211ENST00000490316 GLI3P10071 1580 aa41.84■■■■■ 4.29
MTMR1-211ENST00000490316 PLEKHG3A1L390 1219 aa41.84■■■■■ 4.29
MTMR1-211ENST00000490316 QRICH2Q9H0J4 1663 aa41.84■■■■■ 4.29
MTMR1-211ENST00000490316 ACEP12821 1306 aa41.83■■■■■ 4.29
MTMR1-211ENST00000490316 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
MTMR1-211ENST00000490316 VPS72Q15906 364 aa41.82■■■■■ 4.29
MTMR1-211ENST00000490316 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.81■■■■■ 4.28
MTMR1-211ENST00000490316 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.81■■■■■ 4.28
MTMR1-211ENST00000490316 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
MTMR1-211ENST00000490316 CABP2Q9NPB3 220 aa41.77■■■■■ 4.28
MTMR1-211ENST00000490316 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
MTMR1-211ENST00000490316 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
MTMR1-211ENST00000490316 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa41.74■■■■■ 4.27
MTMR1-211ENST00000490316 BTG4Q9NY30 223 aa41.73■■■■■ 4.27
MTMR1-211ENST00000490316 NRAPQ86VF7 1730 aa41.71■■■■■ 4.27
MTMR1-211ENST00000490316 NUTM2GQ5VZR2 741 aa41.67■■■■■ 4.26
MTMR1-211ENST00000490316 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
MTMR1-211ENST00000490316 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
MTMR1-211ENST00000490316 PRDM11Q9NQV5 511 aa41.66■■■■■ 4.26
MTMR1-211ENST00000490316 EVC2Q86UK5 1308 aa41.66■■■■■ 4.26
MTMR1-211ENST00000490316 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.65■■■■■ 4.26
MTMR1-211ENST00000490316 ABTB2Q8N961 1025 aa41.64■■■■■ 4.26
MTMR1-211ENST00000490316 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.62■■■■■ 4.25
MTMR1-211ENST00000490316 CABP1Q9NZU7 370 aa41.62■■■■■ 4.25
MTMR1-211ENST00000490316 KIAA0232Q92628 1395 aa41.61■■■■■ 4.25
MTMR1-211ENST00000490316 TONSLQ96HA7 1378 aa41.61■■■■■ 4.25
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC125Q86Z20 511 aa41.59■■■■■ 4.25
MTMR1-211ENST00000490316 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
MTMR1-211ENST00000490316 EP400Q96L91 3159 aa41.57■■■■■ 4.25
MTMR1-211ENST00000490316 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
MTMR1-211ENST00000490316 CHRNA2Q15822 529 aa41.54■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 NLRP13Q86W25 1043 aa41.53■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 USP6P35125 1406 aa41.52■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 USP19O94966 1318 aa41.52■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.52■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 NRKQ7Z2Y5 1582 aa41.51■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa41.51■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa41.51■■■■■ 4.24
MTMR1-211ENST00000490316 A0A0G2JS52 829 aa41.5■■■■■ 4.23
MTMR1-211ENST00000490316 MYT1Q01538 1121 aa41.5■■■■■ 4.23
MTMR1-211ENST00000490316 KRT27Q7Z3Y8 459 aa41.5■■■■■ 4.23
MTMR1-211ENST00000490316 GCP02774 474 aa41.45■■■■■ 4.23
MTMR1-211ENST00000490316 CPDO75976 1380 aa41.45■■■■■ 4.23
MTMR1-211ENST00000490316 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.23
MTMR1-211ENST00000490316 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa41.44■■■■■ 4.22
MTMR1-211ENST00000490316 SSH2Q76I76 1423 aa41.44■■■■■ 4.22
MTMR1-211ENST00000490316 STRN4Q9NRL3 753 aa41.43■■■■■ 4.22
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
MTMR1-211ENST00000490316 NLRP6P59044 892 aa41.41■■■■■ 4.22
MTMR1-211ENST00000490316 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa41.41■■■■■ 4.22
MTMR1-211ENST00000490316 EVA1CP58658 441 aa41.38■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 AKAP12Q02952 1782 aa41.37■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa41.37■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 LMO7Q8WWI1 1683 aa41.36■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa41.36■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 PIK3C2AO00443 1686 aa41.35■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 SLIT3O75094 1523 aa41.34■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa41.33■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
MTMR1-211ENST00000490316 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
MTMR1-211ENST00000490316 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
MTMR1-211ENST00000490316 USP35Q9P2H5 1018 aa41.28■■■■■ 4.2
MTMR1-211ENST00000490316 TTC21AQ8NDW8 1320 aa41.27■■■■■ 4.2
MTMR1-211ENST00000490316 ZRANB1Q9UGI0 708 aa41.26■■■■■ 4.2
MTMR1-211ENST00000490316 DEFB132Q7Z7B7 95 aa41.25■■■■■ 4.19
MTMR1-211ENST00000490316 ZBTB7CA1YPR0 619 aa41.24■■■■■ 4.19
MTMR1-211ENST00000490316 BARGINQ6ZT62 677 aa41.24■■■■■ 4.19
MTMR1-211ENST00000490316 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
MTMR1-211ENST00000490316 FAM182BQ5T319 152 aa41.23■■■■■ 4.19
MTMR1-211ENST00000490316 AATKQ6ZMQ8 1374 aa41.23■■■■■ 4.19
MTMR1-211ENST00000490316 MON2Q7Z3U7 1717 aa41.21■■■■■ 4.19
MTMR1-211ENST00000490316 TCP11L2Q8N4U5 519 aa41.2■■■■■ 4.19
MTMR1-211ENST00000490316 KCNH5Q8NCM2 988 aa41.19■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 TMC1Q8TDI8 760 aa41.19■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 CD163L1Q9NR16 1453 aa41.17■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa41.15■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 COL18A1P39060 1754 aa41.14■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 CRB1P82279 1406 aa41.14■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa41.14■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 RGPD1P0DJD0 1748 aa41.13■■■■■ 4.18
MTMR1-211ENST00000490316 BAG6P46379 1132 aa41.13■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGEF25Q86VW2 580 aa41.13■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 TESK2Q96S53 571 aa41.13■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 SOX12O15370 315 aa41.1■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 SLC24A1O60721 1099 aa41.1■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 PDE3BQ13370 1112 aa41.1■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 FAM196AQ6ZSG2 479 aa41.09■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 AXIN2Q9Y2T1 843 aa41.09■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 TERF2IPQ9NYB0 399 aa41.08■■■■■ 4.17
MTMR1-211ENST00000490316 USP31Q70CQ4 1352 aa41.07■■■■■ 4.16
MTMR1-211ENST00000490316 NFAT5O94916 1531 aa41.06■■■■■ 4.16
MTMR1-211ENST00000490316 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa41.04■■■■■ 4.16
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