RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479263.5

PRKCZ-215, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 1,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-215	ENST00000479263	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PRKCZ-215	ENST00000479263	SHPRH	Q149N8	1683 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PRKCZ-215	ENST00000479263	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PRKCZ-215	ENST00000479263	SSH2	Q76I76	1423 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PRKCZ-215	ENST00000479263	INSR	P06213	1382 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PRKCZ-215	ENST00000479263	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PRKCZ-215	ENST00000479263	FBLN1	P23142	703 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	COG3	Q96JB2	828 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-215	ENST00000479263	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	PIK3C2A	O00443	1686 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	ORAI2	Q96SN7	254 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PRKCZ-215	ENST00000479263	DCC	P43146	1447 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	ATF3	P18847	181 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	MST1R	Q04912	1400 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIF1A	Q12756	1690 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	MSH6	P52701	1360 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	PSME1	Q06323	249 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PRKCZ-215	ENST00000479263	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	USP54	Q70EL1	1684 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	FOXO3	O43524	673 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	NLRP6	P59044	892 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	28.68	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABTB2	Q8N961	1025 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	APAF1	O14727	1248 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	SOX12	O15370	315 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	PEAK1	Q9H792	1746 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PRKCZ-215	ENST00000479263	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PRKCZ-215	ENST00000479263	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PRKCZ-215	ENST00000479263	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRKCZ-215	ENST00000479263	IL13	P35225	146 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PRKCZ-215	ENST00000479263	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PRKCZ-215	ENST00000479263	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZNF521	Q96K83	1311 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PRKCZ-215	ENST00000479263	PDE3B	Q13370	1112 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
PRKCZ-215	ENST00000479263	NFAT5	O94916	1531 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	LTN1	O94822	1766 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	FLT4	P35916	1363 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	HMOX1	P09601	288 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	NGEF	Q8N5V2	710 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	FCHSD2	O94868	740 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	AMPH	P49418	695 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	PXDN	Q92626	1479 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	SLIT3	O75094	1523 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	GOLGA2	Q08379	1002 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	WWC1	Q8IX03	1113 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLEKHG5	O94827	1062 aa		28.45	■■■□□ 2.14

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