RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477768.1

URGCP-211, Transcript of upregulator of cell proliferation, humanhuman

TSL 4

Gene URGCP, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-211ENST00000477768 ABCA3Q99758 1704 aa30.36■■■□□ 2.45
URGCP-211ENST00000477768 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.34■■■□□ 2.45
URGCP-211ENST00000477768 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 USP6P35125 1406 aa30.31■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 AKAP12Q02952 1782 aa30.31■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.31■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.3■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 TMC1Q8TDI8 760 aa30.3■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 ABTB2Q8N961 1025 aa30.28■■■□□ 2.44
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URGCP-211ENST00000477768 SSH2Q76I76 1423 aa30.28■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.27■■■□□ 2.44
URGCP-211ENST00000477768 SLC24A1O60721 1099 aa30.25■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 TMF1P82094 1093 aa30.25■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 USP21Q9UK80 565 aa30.25■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 FAM83GA6ND36 823 aa30.23■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
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URGCP-211ENST00000477768 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.22■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.22■■■□□ 2.43
URGCP-211ENST00000477768 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.21■■■□□ 2.43
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URGCP-211ENST00000477768 PIK3C2AO00443 1686 aa30.19■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.19■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 SLIT2O94813 1529 aa30.18■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 NLRP6P59044 892 aa30.17■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 NLRP13Q86W25 1043 aa30.17■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 USP19O94966 1318 aa30.17■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 A0A1W2PP64 1363 aa30.16■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.16■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 RXRBP28702 533 aa30.15■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
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URGCP-211ENST00000477768 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
URGCP-211ENST00000477768 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.14■■■□□ 2.42
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URGCP-211ENST00000477768 ATRNO75882 1429 aa30.13■■■□□ 2.41
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URGCP-211ENST00000477768 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
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URGCP-211ENST00000477768 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.12■■■□□ 2.41
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URGCP-211ENST00000477768 RGPD5Q99666 1765 aa29.9■■■□□ 2.38
URGCP-211ENST00000477768 EVA1CP58658 441 aa29.89■■■□□ 2.38
URGCP-211ENST00000477768 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.89■■■□□ 2.38
URGCP-211ENST00000477768 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
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URGCP-211ENST00000477768 FBLN1P23142 703 aa29.87■■■□□ 2.37
URGCP-211ENST00000477768 COG3Q96JB2 828 aa29.86■■■□□ 2.37
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