RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476675.5

PRKCE-208, Transcript of protein kinase C epsilon, human

TSL 4

Gene PRKCE, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCE-208	ENST00000476675	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PRKCE-208	ENST00000476675	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PRKCE-208	ENST00000476675	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PRKCE-208	ENST00000476675	FAM83G	A6ND36	823 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PRKCE-208	ENST00000476675	EVC2	Q86UK5	1308 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PRKCE-208	ENST00000476675	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCE-208	ENST00000476675	CABP1	Q9NZU7	370 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCE-208	ENST00000476675	GLI3	P10071	1580 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRKCE-208	ENST00000476675	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PRKCE-208	ENST00000476675	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PRKCE-208	ENST00000476675	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PRKCE-208	ENST00000476675	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.6	■■■□□ 2.17
PRKCE-208	ENST00000476675	NRAP	Q86VF7	1730 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PRKCE-208	ENST00000476675	USP6	P35125	1406 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PRKCE-208	ENST00000476675	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	ABTB2	Q8N961	1025 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	BTG4	Q9NY30	223 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	KIAA0232	Q92628	1395 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	VPS72	Q15906	364 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	CHRNA2	Q15822	529 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	SSH2	Q76I76	1423 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	USP19	O94966	1318 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PRKCE-208	ENST00000476675	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCE-208	ENST00000476675	AKAP12	Q02952	1782 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCE-208	ENST00000476675	PIK3C2A	O00443	1686 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCE-208	ENST00000476675	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PRKCE-208	ENST00000476675	TESK2	Q96S53	571 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PRKCE-208	ENST00000476675	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PRKCE-208	ENST00000476675	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PRKCE-208	ENST00000476675	NLRP13	Q86W25	1043 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	NLRP6	P59044	892 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	GC	P02774	474 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	SLIT3	O75094	1523 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	USP47	Q96K76	1375 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	TMC1	Q8TDI8	760 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	STRN4	Q9NRL3	753 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	CPD	O75976	1380 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	EP400	Q96L91	3159 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PRKCE-208	ENST00000476675	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675		A0A0G2JS52	829 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	MYT1	Q01538	1121 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	28.36	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	SOX12	O15370	315 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675		A0A1W2PP64	1363 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PRKCE-208	ENST00000476675	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	NME9	Q86XW9	330 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	EVA1C	P58658	441 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	USP35	Q9P2H5	1018 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	COL18A1	P39060	1754 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	NFAT5	O94916	1531 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	FAM182B	Q5T319	152 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		28.26	■■■□□ 2.12
PRKCE-208	ENST00000476675	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCE-208	ENST00000476675	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PRKCE-208	ENST00000476675	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PRKCE-208	ENST00000476675	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PRKCE-208	ENST00000476675	USP54	Q70EL1	1684 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PRKCE-208	ENST00000476675	TMF1	P82094	1093 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PRKCE-208	ENST00000476675	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PRKCE-208	ENST00000476675	RGPD5	Q99666	1765 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PRKCE-208	ENST00000476675	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		28.18	■■■□□ 2.1

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