RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 USTQ9Y2C2 406 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 NR1I2O75469 434 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 THAP11Q96EK4 314 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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RABGGTB-207ENST00000470201 BCAMP50895 628 aa8.25□□□□□ -1.09
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RABGGTB-207ENST00000470201 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBBXA8MT70 800 aa8.23□□□□□ -1.09
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RABGGTB-207ENST00000470201 MSS51Q4VC12 460 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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RABGGTB-207ENST00000470201 MAP10Q9P2G4 905 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP9BO43861 1147 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-207ENST00000470201 ATG7O95352 703 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-207ENST00000470201 IFFO2Q5TF58 517 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-207ENST00000470201 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-207ENST00000470201 BRD1O95696 1058 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-207ENST00000470201 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-207ENST00000470201 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-207ENST00000470201 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.17e-7■□□□□ 11
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RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.13□□□□□ -1.11
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RABGGTB-207ENST00000470201 ZPR1O75312 459 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L15C9J2P7 530 aa8.07□□□□□ -1.12
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RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L12C9JPN9 530 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L11C9JVI0 530 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L21D6R901 530 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L18D6R9N7 530 aa8.07□□□□□ -1.12
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