RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 SSH2Q76I76 1423 aa15.38■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAMTS2O95450 1211 aa15.38■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.38■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1W2PP64 1363 aa15.37■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.37■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCA3Q99758 1704 aa15.37■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.36■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.057e-7■■■□□ 16.2
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.36■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PIK3C2AO00443 1686 aa15.35■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.35■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.35■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.35■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 NME9Q86XW9 330 aa15.34■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 ABTB2Q8N961 1025 aa15.34■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
RPRD1B-202ENST00000449186 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.33■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF10O15013 1369 aa15.33■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC24A1O60721 1099 aa15.32■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 C8orf37Q96NL8 207 aa15.32■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 CDCA8Q53HL2 280 aa15.31■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.31■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.31■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.31■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 NLRP6P59044 892 aa15.3■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.29■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 SOX12O15370 315 aa15.29■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC7Q96M83 1385 aa15.28■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 PANK3Q9H999 370 aa15.28■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 USP19O94966 1318 aa15.27■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 AFF2P51816 1311 aa15.27■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM83GA6ND36 823 aa15.27■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 FBLN1P23142 703 aa15.27■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 NGLY1Q96IV0 654 aa15.27■□□□□ 0.04
RPRD1B-202ENST00000449186 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.26■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.26■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 CHRNA2Q15822 529 aa15.26■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 POTEAQ6S8J7 498 aa15.26■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 NLRP13Q86W25 1043 aa15.26■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA0232Q92628 1395 aa15.25■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.25■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 GCP02774 474 aa15.25■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.25■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 SLIT3O75094 1523 aa15.25■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 FYB1O15117 783 aa15.24■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.23■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.23■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.23■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.23■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 USP31Q70CQ4 1352 aa15.23■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 NFAT5O94916 1531 aa15.22■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 USP54Q70EL1 1684 aa15.22■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.21■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 ILDR2Q71H61 639 aa15.21■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.21■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 USP21Q9UK80 565 aa15.21■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 SLIT2O94813 1529 aa15.21■□□□□ 0.03
RPRD1B-202ENST00000449186 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 BTG4Q9NY30 223 aa15.19■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.19■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 RGPD5Q99666 1765 aa15.19■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 NRAPQ86VF7 1730 aa15.18■□□□□ 0.02
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RPRD1B-202ENST00000449186 COL18A1P39060 1754 aa15.18■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 LTN1O94822 1766 aa15.17■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.17■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 CPDO75976 1380 aa15.17■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.17■□□□□ 0.02
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RPRD1B-202ENST00000449186 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.16■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.15■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 STRN4Q9NRL3 753 aa15.15■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 ATRNO75882 1429 aa15.15■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.15■□□□□ 0.02
RPRD1B-202ENST00000449186 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.14■□□□□ 0.01
RPRD1B-202ENST00000449186 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RPRD1B-202ENST00000449186 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RPRD1B-202ENST00000449186 GLI3P10071 1580 aa15.13■□□□□ 0.01
RPRD1B-202ENST00000449186 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.13■□□□□ 0.01
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