RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	25.72	■■□□□ 1.71
MRPL28-203	ENST00000429738	BAG6	P46379	1132 aa		25.71	■■□□□ 1.71
MRPL28-203	ENST00000429738	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		25.7	■■□□□ 1.71
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	25.7	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		25.67	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP7B	P35670	1465 aa		25.66	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	ITSN1	Q15811	1721 aa		25.66	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	NRAP	Q86VF7	1730 aa		25.66	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	ALS2	Q96Q42	1657 aa		25.65	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		25.64	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		25.64	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	25.64	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	25.64	■■□□□ 1.7
MRPL28-203	ENST00000429738	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	25.64	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	LRP5	O75197	1615 aa		25.63	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		25.63	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	25.62	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		25.62	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	25.61	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		25.61	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		25.6	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM182B	Q5T319	152 aa		25.59	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	25.59	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK19	Q9BWU1	502 aa		25.59	■■□□□ 1.69
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		25.57	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		25.57	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		25.55	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	25.54	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	25.54	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		25.53	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		25.53	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	DISP2	A7MBM2	1401 aa		25.53	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		25.52	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	25.52	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		25.52	■■□□□ 1.68
MRPL28-203	ENST00000429738	NEUROD1	Q13562	356 aa		25.51	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		25.51	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0232	Q92628	1395 aa		25.51	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		25.5	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	CHRNA2	Q15822	529 aa		25.5	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	25.49	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	25.48	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		25.48	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	STRN4	Q9NRL3	753 aa		25.48	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	ACE	P12821	1306 aa		25.47	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM37	O94972	964 aa		25.47	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		25.46	■■□□□ 1.67
MRPL28-203	ENST00000429738	EVA1C	P58658	441 aa		25.45	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		25.45	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	25.45	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	25.45	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	25.44	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	APBA3	O96018	575 aa		25.43	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	25.43	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		25.43	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		25.43	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE3B	Q13370	1112 aa		25.42	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CABP2	Q9NPB3	220 aa		25.42	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	USP35	Q9P2H5	1018 aa		25.42	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	25.4	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		25.4	■■□□□ 1.66
MRPL28-203	ENST00000429738	SSH2	Q76I76	1423 aa		25.38	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	ABTB2	Q8N961	1025 aa		25.38	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	25.37	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		25.37	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	25.36	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	EVC2	Q86UK5	1308 aa		25.36	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		25.35	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	CPD	O75976	1380 aa		25.35	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		25.35	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	CABP1	Q9NZU7	370 aa		25.34	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	USP19	O94966	1318 aa		25.34	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	USP6	P35125	1406 aa		25.33	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	NBPF14	Q5TI25	921 aa		25.33	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	25.33	■■□□□ 1.65
MRPL28-203	ENST00000429738	NLRP13	Q86W25	1043 aa		25.32	■■□□□ 1.64
MRPL28-203	ENST00000429738	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		25.31	■■□□□ 1.64
MRPL28-203	ENST00000429738	GC	P02774	474 aa		25.31	■■□□□ 1.64
MRPL28-203	ENST00000429738	TONSL	Q96HA7	1378 aa		25.31	■■□□□ 1.64
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	25.28	■■□□□ 1.64
MRPL28-203	ENST00000429738	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		25.28	■■□□□ 1.64
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP12	Q02952	1782 aa		25.28	■■□□□ 1.64
MRPL28-203	ENST00000429738	RREB1	Q92766	1687 aa		25.26	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		25.26	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3C2A	O00443	1686 aa		25.25	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	SLIT3	O75094	1523 aa		25.24	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		25.23	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	25.22	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	25.22	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	25.21	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	SPON1	Q9HCB6	807 aa		25.21	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CRB1	P82279	1406 aa		25.2	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	25.2	■■□□□ 1.63
MRPL28-203	ENST00000429738	NLRP6	P59044	892 aa		25.2	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNQ2	O43526	872 aa		25.19	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		25.18	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		25.18	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		25.18	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		25.17	■■□□□ 1.62
MRPL28-203	ENST00000429738	PLSCR1	O15162	318 aa		25.17	■■□□□ 1.62

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