RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.11■■■□□ 2.41
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UBXN4-204ENST00000426921 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.08■■■□□ 2.41
UBXN4-204ENST00000426921 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
UBXN4-204ENST00000426921 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
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UBXN4-204ENST00000426921 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.95■■■□□ 2.38
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UBXN4-204ENST00000426921 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.82■■■□□ 2.36
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UBXN4-204ENST00000426921 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
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UBXN4-204ENST00000426921 USP31Q70CQ4 1352 aa29.55■■■□□ 2.32
UBXN4-204ENST00000426921 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
UBXN4-204ENST00000426921 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.54■■■□□ 2.32
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.54■■■□□ 2.32
UBXN4-204ENST00000426921 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.54■■■□□ 2.32
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC37A3O60309 1634 aa29.53■■■□□ 2.32
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM37O94972 964 aa29.53■■■□□ 2.32
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