RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 ALS2Q96Q42 1657 aa28.58■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.57■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 ARHGEF10O15013 1369 aa28.56■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 SSH2Q76I76 1423 aa28.56■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.56■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 A0A1W2PP64 1363 aa28.55■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.55■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.54■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.53■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 CCDC7Q96M83 1385 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PMS1-211ENST00000424766 ABTB2Q8N961 1025 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-211ENST00000424766 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-211ENST00000424766 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-211ENST00000424766 NLRP13Q86W25 1043 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-211ENST00000424766 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 PANK3Q9H999 370 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 PIK3C2AO00443 1686 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 NLRP6P59044 892 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 USP31Q70CQ4 1352 aa28.39■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 NME9Q86XW9 330 aa28.39■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 ABCA3Q99758 1704 aa28.39■■■□□ 2.14
PMS1-211ENST00000424766 USP19O94966 1318 aa28.39■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 LRP6O75581 1613 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 USP54Q70EL1 1684 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHG5O94827 1062 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 FYB1O15117 783 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 ADAMTS2O95450 1211 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 GCP02774 474 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-211ENST00000424766 SLIT3O75094 1523 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.31■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.3■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 COG3Q96JB2 828 aa28.3■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.29■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.29■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.28■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PMS1-211ENST00000424766 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 NGLY1Q96IV0 654 aa28.25■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 C8orf37Q96NL8 207 aa28.25■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 CPDO75976 1380 aa28.24■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 FAM83GA6ND36 823 aa28.23■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 NSD2O96028 1365 aa28.23■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.22■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 KIAA0232Q92628 1395 aa28.22■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.21■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 NFAT5O94916 1531 aa28.21■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PMS1-211ENST00000424766 SOX12O15370 315 aa28.19■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.19■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 AFF2P51816 1311 aa28.18■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.17■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.16■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 SLIT2O94813 1529 aa28.16■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 CHRNA2Q15822 529 aa28.15■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.15■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 LTN1O94822 1766 aa28.14■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.14■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
PMS1-211ENST00000424766 USP21Q9UK80 565 aa28.13■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 COL18A1P39060 1754 aa28.13■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 MORC1Q86VD1 984 aa28.12■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 BTG4Q9NY30 223 aa28.12■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 FBLN1P23142 703 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 ABCC6O95255 1503 aa28.09■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-211ENST00000424766 RGPD5Q99666 1765 aa28.08■■■□□ 2.09
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