RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414510.5

PTPA-210, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPA, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-210ENST00000414510 AKAP12Q02952 1782 aa34.44■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.44■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 USP47Q96K76 1375 aa34.44■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.43■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 SOCS7O14512 581 aa34.42■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.41■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 TESK2Q96S53 571 aa34.41■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 USP6P35125 1406 aa34.4■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.39■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 USP21Q9UK80 565 aa34.39■■■■□ 3.1
PTPA-210ENST00000414510 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.37■■■■□ 3.09
PTPA-210ENST00000414510 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
PTPA-210ENST00000414510 SLIT2O94813 1529 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPA-210ENST00000414510 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
PTPA-210ENST00000414510 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPA-210ENST00000414510 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.33■■■■□ 3.09
PTPA-210ENST00000414510 PIK3C2AO00443 1686 aa34.32■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 ATRNO75882 1429 aa34.32■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 RXRBP28702 533 aa34.32■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 SSH2Q76I76 1423 aa34.31■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 ABTB2Q8N961 1025 aa34.31■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.3■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.29■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 NRAPQ86VF7 1730 aa34.27■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 FAM83GA6ND36 823 aa34.26■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 TMC1Q8TDI8 760 aa34.26■■■■□ 3.08
PTPA-210ENST00000414510 RGS12O14924 1447 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa34.24■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 USP19O94966 1318 aa34.24■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.23■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.22■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 KIAA0232Q92628 1395 aa34.21■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 GLI3P10071 1580 aa34.2■■■■□ 3.07
PTPA-210ENST00000414510 TMF1P82094 1093 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 NLRP13Q86W25 1043 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 SLIT3O75094 1523 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.18■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 A0A1W2PP64 1363 aa34.18■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 NLRP6P59044 892 aa34.17■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 CHRNA2Q15822 529 aa34.16■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 BTG4Q9NY30 223 aa34.16■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 SLC24A1O60721 1099 aa34.15■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.14■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PTPA-210ENST00000414510 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 MYOM1P52179 1685 aa34.12■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.12■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.12■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 GCP02774 474 aa34.11■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.11■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 USP54Q70EL1 1684 aa34.1■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.1■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 VPS72Q15906 364 aa34.09■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.09■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 CPDO75976 1380 aa34.09■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
PTPA-210ENST00000414510 NME9Q86XW9 330 aa34.07■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.06■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.05■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.04■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.04■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 SOX12O15370 315 aa34.03■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 NFAT5O94916 1531 aa34.03■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 CDCA8Q53HL2 280 aa34.02■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 USP31Q70CQ4 1352 aa34.01■■■■□ 3.04
PTPA-210ENST00000414510 COL18A1P39060 1754 aa34■■■■□ 3.03
PTPA-210ENST00000414510 BRWD3Q6RI45 1802 aa34■■■■□ 3.03
PTPA-210ENST00000414510 STRN4Q9NRL3 753 aa34■■■■□ 3.03
PTPA-210ENST00000414510 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPA-210ENST00000414510 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.96■■■■□ 3.03
PTPA-210ENST00000414510 RGPD5Q99666 1765 aa33.95■■■■□ 3.03
PTPA-210ENST00000414510 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa33.95■■■■□ 3.03
PTPA-210ENST00000414510 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa33.95■■■■□ 3.03
PTPA-210ENST00000414510 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 KCNH5Q8NCM2 988 aa33.94■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.94■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 LTN1O94822 1766 aa33.93■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.93■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 KIF20BQ96Q89 1820 aa33.92■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.91■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 SEPT12Q8IYM1 358 aa33.91■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 EVA1CP58658 441 aa33.9■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa33.9■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa33.89■■■■□ 3.02
PTPA-210ENST00000414510 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
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