RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRN2-204ENST00000404321 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRN2-204ENST00000404321 ALS2Q96Q42 1657 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM83GA6ND36 823 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 ATRNO75882 1429 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 ABTB2Q8N961 1025 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 ABCA3Q99758 1704 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 SLIT2O94813 1529 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 RGS12O14924 1447 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 USP6P35125 1406 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRN2-204ENST00000404321 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
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PTPRN2-204ENST00000404321 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRN2-204ENST00000404321 TESK2Q96S53 571 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRN2-204ENST00000404321 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.61■■□□□ 1.69
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PTPRN2-204ENST00000404321 USP47Q96K76 1375 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRN2-204ENST00000404321 BTG4Q9NY30 223 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRN2-204ENST00000404321 KIAA0232Q92628 1395 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRN2-204ENST00000404321 CHRNA2Q15822 529 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRN2-204ENST00000404321 NLRP6P59044 892 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 NLRP13Q86W25 1043 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 SSH2Q76I76 1423 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 VPS72Q15906 364 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 USP19O94966 1318 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 GCP02774 474 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 GLI3P10071 1580 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRN2-204ENST00000404321 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
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PTPRN2-204ENST00000404321 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 STRN4Q9NRL3 753 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 SOX12O15370 315 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 TMF1P82094 1093 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 PIK3C2AO00443 1686 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 AKAP12Q02952 1782 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 NRAPQ86VF7 1730 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 A0A1W2PP64 1363 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 A0A0G2JS52 829 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC24A1O60721 1099 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 MYT1Q01538 1121 aa25.45■■□□□ 1.67
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PTPRN2-204ENST00000404321 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRN2-204ENST00000404321 CPDO75976 1380 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 EVA1CP58658 441 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 SLIT3O75094 1523 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 USP35Q9P2H5 1018 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRN2-204ENST00000404321 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.39■■□□□ 1.66
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PTPRN2-204ENST00000404321 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 CDCA8Q53HL2 280 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 USP31Q70CQ4 1352 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRN2-204ENST00000404321 NFAT5O94916 1531 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM182BQ5T319 152 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRN2-204ENST00000404321 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRN2-204ENST00000404321 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.28■■□□□ 1.64
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