RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396914.3

CHCHD4-202, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-202ENST00000396914 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.89■■■■■ 4.14
CHCHD4-202ENST00000396914 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
CHCHD4-202ENST00000396914 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 NINLQ9Y2I6 1382 aa40.87■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 AKAP12Q02952 1782 aa40.86■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 LRP6O75581 1613 aa40.86■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 NUTM2GQ5VZR2 741 aa40.85■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 ADAMTS2O95450 1211 aa40.84■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 ABTB2Q8N961 1025 aa40.84■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 ALS2Q96Q42 1657 aa40.84■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 CABLES1Q8TDN4 633 aa40.84■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
CHCHD4-202ENST00000396914 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.8■■■■■ 4.12
CHCHD4-202ENST00000396914 A0A1W2PP64 1363 aa40.79■■■■■ 4.12
CHCHD4-202ENST00000396914 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa40.77■■■■■ 4.12
CHCHD4-202ENST00000396914 MON2Q7Z3U7 1717 aa40.76■■■■■ 4.12
CHCHD4-202ENST00000396914 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.76■■■■■ 4.12
CHCHD4-202ENST00000396914 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 C8orf37Q96NL8 207 aa40.74■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa40.73■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 SSH2Q76I76 1423 aa40.72■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 NLRP6P59044 892 aa40.71■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 NLRP13Q86W25 1043 aa40.71■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.71■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 MYOM1P52179 1685 aa40.7■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 NRKQ7Z2Y5 1582 aa40.7■■■■■ 4.11
CHCHD4-202ENST00000396914 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
CHCHD4-202ENST00000396914 NGLY1Q96IV0 654 aa40.67■■■■■ 4.1
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCA3Q99758 1704 aa40.67■■■■■ 4.1
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.65■■■■■ 4.1
CHCHD4-202ENST00000396914 PIK3C2AO00443 1686 aa40.65■■■■■ 4.1
CHCHD4-202ENST00000396914 NME9Q86XW9 330 aa40.62■■■■■ 4.09
CHCHD4-202ENST00000396914 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
CHCHD4-202ENST00000396914 AFF2P51816 1311 aa40.59■■■■■ 4.09
CHCHD4-202ENST00000396914 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
CHCHD4-202ENST00000396914 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa40.59■■■■■ 4.09
CHCHD4-202ENST00000396914 ZRANB1Q9UGI0 708 aa40.58■■■■■ 4.09
CHCHD4-202ENST00000396914 USP19O94966 1318 aa40.57■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 SOX12O15370 315 aa40.55■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 GCP02774 474 aa40.53■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 CARD14Q9BXL6 1004 aa40.53■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 PANK3Q9H999 370 aa40.53■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 CCDC7Q96M83 1385 aa40.53■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 NSD3Q9BZ95 1437 aa40.52■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 ZBTB7CA1YPR0 619 aa40.51■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 PRDM11Q9NQV5 511 aa40.51■■■■■ 4.08
CHCHD4-202ENST00000396914 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.5■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 USP21Q9UK80 565 aa40.5■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 KIAA0232Q92628 1395 aa40.49■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 FAM83GA6ND36 823 aa40.49■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 USP31Q70CQ4 1352 aa40.48■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.47■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 COG3Q96JB2 828 aa40.47■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 SLIT3O75094 1523 aa40.46■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 CHRNA2Q15822 529 aa40.45■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
CHCHD4-202ENST00000396914 GGNBP2Q9H3C7 697 aa40.44■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 FYB1O15117 783 aa40.42■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 PLCH1Q4KWH8 1693 aa40.4■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF20BQ96Q89 1820 aa40.4■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 POTEAQ6S8J7 498 aa40.4■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 BTG4Q9NY30 223 aa40.4■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 CGNL1Q0VF96 1302 aa40.4■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa40.39■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 OVOS2Q6IE36 1432 aa40.39■■■■■ 4.06
CHCHD4-202ENST00000396914 USP54Q70EL1 1684 aa40.38■■■■■ 4.05
CHCHD4-202ENST00000396914 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
CHCHD4-202ENST00000396914 SLIT2O94813 1529 aa40.37■■■■■ 4.05
CHCHD4-202ENST00000396914 CPDO75976 1380 aa40.37■■■■■ 4.05
CHCHD4-202ENST00000396914 UNC5CLQ8IV45 518 aa40.36■■■■■ 4.05
CHCHD4-202ENST00000396914 BCL9LQ86UU0 1499 aa40.35■■■■■ 4.05
CHCHD4-202ENST00000396914 KNSTRNQ9Y448 316 aa40.34■■■■■ 4.05
CHCHD4-202ENST00000396914 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
CHCHD4-202ENST00000396914 NWD2Q9ULI1 1742 aa40.31■■■■■ 4.04
CHCHD4-202ENST00000396914 NFAT5O94916 1531 aa40.31■■■■■ 4.04
CHCHD4-202ENST00000396914 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
CHCHD4-202ENST00000396914 EVA1CP58658 441 aa40.28■■■■■ 4.04
CHCHD4-202ENST00000396914 ARHGEF25Q86VW2 580 aa40.28■■■■■ 4.04
CHCHD4-202ENST00000396914 STRN4Q9NRL3 753 aa40.28■■■■■ 4.04
CHCHD4-202ENST00000396914 RXRBP28702 533 aa40.26■■■■■ 4.04
CHCHD4-202ENST00000396914 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.03
CHCHD4-202ENST00000396914 AATKQ6ZMQ8 1374 aa40.24■■■■■ 4.03
CHCHD4-202ENST00000396914 ATRNO75882 1429 aa40.24■■■■■ 4.03
CHCHD4-202ENST00000396914 FBLN1P23142 703 aa40.23■■■■■ 4.03
CHCHD4-202ENST00000396914 NRAPQ86VF7 1730 aa40.22■■■■■ 4.03
CHCHD4-202ENST00000396914 LTN1O94822 1766 aa40.21■■■■■ 4.03
CHCHD4-202ENST00000396914 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
CHCHD4-202ENST00000396914 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa40.2■■■■■ 4.03
CHCHD4-202ENST00000396914 VPS72Q15906 364 aa40.19■■■■■ 4.02
CHCHD4-202ENST00000396914 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.19■■■■■ 4.02
CHCHD4-202ENST00000396914 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
CHCHD4-202ENST00000396914 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
CHCHD4-202ENST00000396914 ILDR2Q71H61 639 aa40.17■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms