RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 SSH2Q76I76 1423 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 A0A1W2PP64 1363 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.93■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 ARHGEF10O15013 1369 aa24.93■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.93■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 CCDC7Q96M83 1385 aa24.92■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 ALS2Q96Q42 1657 aa24.92■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.89■■□□□ 1.57
UPP1-203ENST00000395564 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-203ENST00000395564 ABTB2Q8N961 1025 aa24.85■■□□□ 1.57
UPP1-203ENST00000395564 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
UPP1-203ENST00000395564 NLRP13Q86W25 1043 aa24.81■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 PANK3Q9H999 370 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 PIK3C2AO00443 1686 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 USP31Q70CQ4 1352 aa24.79■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 NLRP6P59044 892 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 USP19O94966 1318 aa24.77■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.77■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 USP54Q70EL1 1684 aa24.77■■□□□ 1.56
UPP1-203ENST00000395564 ABCA3Q99758 1704 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.75■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 NME9Q86XW9 330 aa24.75■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 LRP6O75581 1613 aa24.74■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 SLIT3O75094 1523 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 FYB1O15117 783 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
UPP1-203ENST00000395564 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 GCP02774 474 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 COG3Q96JB2 828 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 NSD2O96028 1365 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 PLEKHG5O94827 1062 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 ADAMTS2O95450 1211 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 CPDO75976 1380 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-203ENST00000395564 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.63■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 NFAT5O94916 1531 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 C8orf37Q96NL8 207 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 KIAA0232Q92628 1395 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 NGLY1Q96IV0 654 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-203ENST00000395564 FAM83GA6ND36 823 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 SLIT2O94813 1529 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 SOX12O15370 315 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 ABCC6O95255 1503 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 AFF2P51816 1311 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 MORC1Q86VD1 984 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 LTN1O94822 1766 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 CHRNA2Q15822 529 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-203ENST00000395564 BTG4Q9NY30 223 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 USP21Q9UK80 565 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 COL18A1P39060 1754 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 RTL1A6NKG5 1358 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 NRAPQ86VF7 1730 aa24.47■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 FBLN1P23142 703 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms