RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRC-202ENST00000367364 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 ADH1CP00326 375 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 VSIG8P0DPA2 414 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 DESI1Q6ICB0 168 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 MTMR2Q13614 643 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 SCARF1Q14162 830 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYE5A6NIY4 337 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 FAM174AQ8TBP5 190 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 FOXJ1Q92949 421 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 CDK15Q96Q40 435 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 LYPD8Q6UX82 237 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 NR3C2P08235 984 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 ITPKCQ96DU7 683 aa12.23□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 CTHP32929 405 aa12.22□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 CFAP99D6REC4 459 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 MAP10Q9P2G4 905 aa12.21□□□□□ -0.45
PTPRC-202ENST00000367364 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf118Q5T5N4 469 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 GSK3AP49840 483 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 ARID5BQ14865 1188 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 AMHR2Q16671 573 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 MAN1A2O60476 641 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 PPFIA3O75145 1194 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 GJA5P36382 358 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 GRM5P41594 1212 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 BEGAINQ9BUH8 593 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 NR5A1Q13285 461 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 KCNMA1Q12791 1236 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRC-202ENST00000367364 HRCP23327 699 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 MEIOBQ8N635 442 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 BARGINQ6ZT62 677 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 DNMT3LQ9UJW3 386 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 SPTLC1O15269 473 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 BMP2P12643 396 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 KRT76Q01546 638 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD17Q8N5Z5 321 aa12.11□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 ZMYND10O75800 440 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 AGERQ15109 404 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-202ENST00000367364 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 UPP2O95045 317 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 PARP9Q8IXQ6 854 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 FSHRP23945 695 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRC-202ENST00000367364 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa12.02□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 RASSF7Q02833 373 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 PTSQ03393 145 aa12□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM151AQ8N4L1 468 aa12□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 QPCTQ16769 361 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 TTLL8A6PVC2 850 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 GDF11O95390 407 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 TSC1Q92574 1164 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM66O15016 1216 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRC-202ENST00000367364 NBPF14Q5TI25 921 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRC-202ENST00000367364 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRC-202ENST00000367364 LILRB3O75022 631 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms