RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.1■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 ACEP12821 1306 aa22.09■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.08■■□□□ 1.13
NSL1-201ENST00000366976 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.07■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.07■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 ALS2Q96Q42 1657 aa22.07■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 SLIT2O94813 1529 aa22.06■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.06■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 ATRNO75882 1429 aa22.06■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.05■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.05■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 CABP2Q9NPB3 220 aa22.05■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.05■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.04■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.03■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 CABP1Q9NZU7 370 aa22.02■■□□□ 1.12
NSL1-201ENST00000366976 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.01■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 EP400Q96L91 3159 aa22■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 FAM83GA6ND36 823 aa21.99■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 VPS72Q15906 364 aa21.98■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 NLRP13Q86W25 1043 aa21.98■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.97■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 ABTB2Q8N961 1025 aa21.97■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 USP6P35125 1406 aa21.97■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 ABCA3Q99758 1704 aa21.96■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.96■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 SSH2Q76I76 1423 aa21.96■■□□□ 1.11
NSL1-201ENST00000366976 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 USP19O94966 1318 aa21.95■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.94■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 CPDO75976 1380 aa21.93■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.93■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 TESK2Q96S53 571 aa21.93■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.92■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.92■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.91■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.91■■□□□ 1.1
NSL1-201ENST00000366976 GCP02774 474 aa21.89■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 BTG4Q9NY30 223 aa21.89■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.87■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.87■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 KIAA0232Q92628 1395 aa21.87■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 NLRP6P59044 892 aa21.86■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 CDCA8Q53HL2 280 aa21.86■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.86■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 GLI3P10071 1580 aa21.86■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 CCDC125Q86Z20 511 aa21.85■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.85■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 USP47Q96K76 1375 aa21.84■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 TMF1P82094 1093 aa21.83■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.83■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 AKAP12Q02952 1782 aa21.83■■□□□ 1.09
NSL1-201ENST00000366976 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.82■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.82■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 SLIT3O75094 1523 aa21.82■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 PLEKHG5O94827 1062 aa21.82■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 USP31Q70CQ4 1352 aa21.82■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.81■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.81■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.81■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.81■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 NRAPQ86VF7 1730 aa21.8■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.79■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 TMC1Q8TDI8 760 aa21.79■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.77■■□□□ 1.08
NSL1-201ENST00000366976 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.77■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 LRP5O75197 1615 aa21.77■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 PIK3C2AO00443 1686 aa21.76■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 EVA1CP58658 441 aa21.76■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 CHRNA2Q15822 529 aa21.76■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 BARGINQ6ZT62 677 aa21.76■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.76■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.75■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.74■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 A0A1W2PP64 1363 aa21.74■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.73■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.73■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.73■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 USP54Q70EL1 1684 aa21.72■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 ABCC6O95255 1503 aa21.72■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NSL1-201ENST00000366976 STRN4Q9NRL3 753 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms