RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GRM1Q13255 1194 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 BRINP3Q76B58 766 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 FBXW7Q969H0 707 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 HMOX1P09601 288 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PANK3Q9H999 370 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 TMOD3Q9NYL9 352 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 GCP02774 474 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-201ENST00000348564 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-7P63135 1459 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ZPR1O75312 459 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 MIER1Q8N108 512 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 CLTCL1P53675 1640 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.48
PTPRC-201ENST00000348564 REREQ9P2R6 1566 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 NME9Q86XW9 330 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 UNC5CLQ8IV45 518 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 NECTIN2Q92692 538 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 RFC4P35249 363 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB132Q7Z7B7 95 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SOCS7O14512 581 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 KIF1BO60333 1816 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 KIF7Q2M1P5 1343 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.498e-6■■■□□ 16.1
PTPRC-201ENST00000348564 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 STK31Q9BXU1 1019 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-201ENST00000348564 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC7Q96M83 1385 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB7AO95365 584 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SPON1Q9HCB6 807 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ4P48050 445 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SYNMO15061 1565 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF10O15013 1369 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ATAD2Q6PL18 1390 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP1Q9C000 1473 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 MSL1Q68DK7 614 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 PREX1Q8TCU6 1659 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 A2ML1A8K2U0 1454 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 STARD3NLO95772 234 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRC-201ENST00000348564 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRB3O60242 1522 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-201ENST00000348564 BCS1LQ9Y276 419 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 MYOM2P54296 1465 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 FBLN1P23142 703 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 GORABQ5T7V8 394 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 LMOD3Q0VAK6 560 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-201ENST00000348564 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
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