RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDM11Q9NQV5 511 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 GNAI2P04899 355 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 ERC1Q8IUD2 1116 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K1Q13233 1512 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 PES1O00541 588 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC4A2P04920 1241 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCC5O15440 1437 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 FCHSD2O94868 740 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CABP4P57796 275 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 GCC1Q96CN9 775 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CCT4P50991 539 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 FSD1Q9BTV5 496 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF14Q15058 1648 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP89Q96ST8 783 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-201ENST00000344528 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 TPM2P07951 284 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 TPM1P09493 284 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF428Q96B54 188 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMA5P28066 241 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 HIP1O00291 1037 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 BICD2Q8TD16 824 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNH5Q8NCM2 988 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC27Q2M243 656 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 AKNAQ7Z591 1439 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM177BA6PVY3 158 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 NCOA1Q15788 1441 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4-201ENST00000344528 GSE1Q14687 1217 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 BCAR3O75815 825 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 NFE2L2Q16236 605 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 SART3Q15020 963 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 CNNM1Q9NRU3 951 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 XBP1P17861 261 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL34Q8N239 644 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 MCM2P49736 904 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 FYB1O15117 783 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR97A6NE52 1622 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 IDI1Q13907 227 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 BRMS1Q9HCU9 246 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 MVPQ14764 893 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRCC1Q9C099 1032 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 BTBD11A6QL63 1104 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4-201ENST00000344528 FANCAO15360 1455 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 GNAT3A8MTJ3 354 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 RABEP1Q15276 862 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 PDCP20941 246 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 NEK4P51957 841 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC39AQ5SRH9 613 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 MYL6BP14649 208 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-201ENST00000344528 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.7 ms