RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 KCNA6P17658 529 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.373e-42■□□□□ 8.5
ACTB-201ENST00000331789 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 SLFN5Q08AF3 891 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 PIK3R4Q99570 1358 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 NGEFQ8N5V2 710 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 ACEP12821 1306 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 POLKQ9UBT6 870 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 NEUROD2Q15784 382 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 WWC1Q8IX03 1113 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-201ENST00000331789 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 COG3Q96JB2 828 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 E9PSI1 815 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 USP6P35125 1406 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 PLIN1O60240 522 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-201ENST00000331789 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 CCDC27Q2M243 656 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 SSH2Q76I76 1423 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 WDR63Q8IWG1 891 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.39■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.39■■□□□ 1.34
ACTB-201ENST00000331789 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 IL13P35225 146 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 FCHSD2O94868 740 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 HMOX1P09601 288 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 PRKAR2BP31323 418 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 USP31Q70CQ4 1352 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-201ENST00000331789 CRBNQ96SW2 442 aa23.33■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 RIPK4P57078 832 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 SOX12O15370 315 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 BCAR3O75815 825 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 PIK3C2AO00443 1686 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 PEAK1Q9H792 1746 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 NWD1Q149M9 1564 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 C14orf37Q86TY3 774 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.28■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ACTB-201ENST00000331789 NEFMP07197 916 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 NLRP6P59044 892 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.25■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 NFE2L2Q16236 605 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 ABTB2Q8N961 1025 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ACTB-201ENST00000331789 IL16Q14005 1332 aa23.21■■□□□ 1.31
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