RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.34■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.34■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.34■■□□□ 1.17
SSR4-201ENST00000320857 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.32■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 AKAP12Q02952 1782 aa22.32■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.32■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 E9PSI1 815 aa22.31■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 ITSN1Q15811 1721 aa22.31■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.29■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 KCNA6P17658 529 aa22.29■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.28■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.27■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.27■■□□□ 1.16
SSR4-201ENST00000320857 WWC1Q8IX03 1113 aa22.26■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 CCDC27Q2M243 656 aa22.25■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.24■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 NME9Q86XW9 330 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 WDR63Q8IWG1 891 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 COG3Q96JB2 828 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 ACEP12821 1306 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.21■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 POLKQ9UBT6 870 aa22.21■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.21■■□□□ 1.15
SSR4-201ENST00000320857 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 NUTM2FA1L443 756 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 NEUROD2Q15784 382 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 USP6P35125 1406 aa22.18■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.17■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.17■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 PLIN1O60240 522 aa22.17■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.16■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.16■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 SSH2Q76I76 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 NWD1Q149M9 1564 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.14■■□□□ 1.14
SSR4-201ENST00000320857 FCHSD2O94868 740 aa22.14■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.12■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.11■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.11■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 CRBNQ96SW2 442 aa22.11■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.11■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.11■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 NEFMP07197 916 aa22.11■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 FBLN1P23142 703 aa22.11■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.09■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.09■■□□□ 1.13
SSR4-201ENST00000320857 IL13P35225 146 aa22.07■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.07■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 IL16Q14005 1332 aa22.06■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.06■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.05■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.05■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 USP31Q70CQ4 1352 aa22.05■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 PRKAR2BP31323 418 aa22.04■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 RIPK4P57078 832 aa22.04■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 C14orf37Q86TY3 774 aa22.04■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.04■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 BCAR3O75815 825 aa22.04■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 TMEM94Q12767 1356 aa22.02■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SSR4-201ENST00000320857 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.01■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 PIK3C2AO00443 1686 aa22■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 RARSP54136 660 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 HMOX1P09601 288 aa21.99■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 PDE3AQ14432 1141 aa21.99■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 NFE2L2Q16236 605 aa21.99■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 USP54Q70EL1 1684 aa21.99■■□□□ 1.11
SSR4-201ENST00000320857 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.98■■□□□ 1.11
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