RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308153.8

H2AFV-202, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2AFV, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-202ENST00000308153 FAM83GA6ND36 823 aa41.58■■■■■ 4.25
H2AFV-202ENST00000308153 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.58■■■■■ 4.25
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H2AFV-202ENST00000308153 EP400Q96L91 3159 aa41.55■■■■■ 4.24
H2AFV-202ENST00000308153 QRICH2Q9H0J4 1663 aa41.55■■■■■ 4.24
H2AFV-202ENST00000308153 ACEP12821 1306 aa41.54■■■■■ 4.24
H2AFV-202ENST00000308153 VPS72Q15906 364 aa41.54■■■■■ 4.24
H2AFV-202ENST00000308153 PLEKHG3A1L390 1219 aa41.53■■■■■ 4.24
H2AFV-202ENST00000308153 NRAPQ86VF7 1730 aa41.49■■■■■ 4.23
H2AFV-202ENST00000308153 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.49■■■■■ 4.23
H2AFV-202ENST00000308153 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
H2AFV-202ENST00000308153 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
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H2AFV-202ENST00000308153 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
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H2AFV-202ENST00000308153 NUTM2GQ5VZR2 741 aa41.37■■■■■ 4.21
H2AFV-202ENST00000308153 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.37■■■■■ 4.21
H2AFV-202ENST00000308153 PRDM11Q9NQV5 511 aa41.35■■■■■ 4.21
H2AFV-202ENST00000308153 KIAA0232Q92628 1395 aa41.35■■■■■ 4.21
H2AFV-202ENST00000308153 EVC2Q86UK5 1308 aa41.3■■■■■ 4.2
H2AFV-202ENST00000308153 ABTB2Q8N961 1025 aa41.3■■■■■ 4.2
H2AFV-202ENST00000308153 CABP1Q9NZU7 370 aa41.3■■■■■ 4.2
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H2AFV-202ENST00000308153 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa41.26■■■■■ 4.2
H2AFV-202ENST00000308153 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa41.26■■■■■ 4.2
H2AFV-202ENST00000308153 CHRNA2Q15822 529 aa41.26■■■■■ 4.2
H2AFV-202ENST00000308153 USP6P35125 1406 aa41.26■■■■■ 4.19
H2AFV-202ENST00000308153 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
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H2AFV-202ENST00000308153 KRT27Q7Z3Y8 459 aa41.21■■■■■ 4.19
H2AFV-202ENST00000308153 SSH2Q76I76 1423 aa41.2■■■■■ 4.19
H2AFV-202ENST00000308153 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 CPDO75976 1380 aa41.19■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 NLRP13Q86W25 1043 aa41.18■■■■■ 4.18
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H2AFV-202ENST00000308153 A0A0G2JS52 829 aa41.16■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 MYT1Q01538 1121 aa41.16■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa41.16■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.15■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 LMO7Q8WWI1 1683 aa41.14■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 GCP02774 474 aa41.14■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa41.14■■■■■ 4.18
H2AFV-202ENST00000308153 STRN4Q9NRL3 753 aa41.13■■■■■ 4.17
H2AFV-202ENST00000308153 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa41.13■■■■■ 4.17
H2AFV-202ENST00000308153 PIK3C2AO00443 1686 aa41.1■■■■■ 4.17
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H2AFV-202ENST00000308153 AKAP12Q02952 1782 aa41.09■■■■■ 4.17
H2AFV-202ENST00000308153 NLRP6P59044 892 aa41.07■■■■■ 4.17
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H2AFV-202ENST00000308153 DEFB132Q7Z7B7 95 aa41.02■■■■■ 4.16
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H2AFV-202ENST00000308153 USP35Q9P2H5 1018 aa40.97■■■■■ 4.15
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H2AFV-202ENST00000308153 ZRANB1Q9UGI0 708 aa40.96■■■■■ 4.15
H2AFV-202ENST00000308153 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa40.95■■■■■ 4.15
H2AFV-202ENST00000308153 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.95■■■■■ 4.15
H2AFV-202ENST00000308153 AATKQ6ZMQ8 1374 aa40.95■■■■■ 4.15
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H2AFV-202ENST00000308153 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.94■■■■■ 4.14
H2AFV-202ENST00000308153 COL18A1P39060 1754 aa40.91■■■■■ 4.14
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H2AFV-202ENST00000308153 BAG6P46379 1132 aa40.83■■■■■ 4.13
H2AFV-202ENST00000308153 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
H2AFV-202ENST00000308153 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.83■■■■■ 4.13
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H2AFV-202ENST00000308153 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.81■■■■■ 4.12
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H2AFV-202ENST00000308153 FAM196AQ6ZSG2 479 aa40.79■■■■■ 4.12
H2AFV-202ENST00000308153 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.79■■■■■ 4.12
H2AFV-202ENST00000308153 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
H2AFV-202ENST00000308153 SOX12O15370 315 aa40.78■■■■■ 4.12
H2AFV-202ENST00000308153 DISP2A7MBM2 1401 aa40.77■■■■■ 4.12
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