RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 BCAR3O75815 825 aa25.35■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.35■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 TSPY26PQ9H489 355 aa25.35■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 KINO60870 393 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.33■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM5Q9C035 493 aa25.33■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.33■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.32■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.32■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 CDR1P51861 262 aa25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 RUFY1Q96T51 708 aa25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 ATF3P18847 181 aa25.3■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.3■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC27Q2M243 656 aa25.3■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.3■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 AK7Q96M32 723 aa25.3■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 PRAM1Q96QH2 718 aa25.29■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.29■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.29■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.29■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A2P04920 1241 aa25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 ERBINQ96RT1 1412 aa25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 MSH5O43196 834 aa25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 PRXQ9BXM0 1461 aa25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF428Q96B54 188 aa25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-201ENST00000284617 ABTB2Q8N961 1025 aa25.26■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 FIBPO43427 364 aa25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 PDILTQ8N807 584 aa25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 CCP110O43303 1012 aa25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD1Q15327 319 aa25.24■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.24■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.23■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.23■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.22■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.22■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 SYNJ1O43426 1573 aa25.22■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 OFD1O75665 1012 aa25.22■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 JMYQ8N9B5 988 aa25.21■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.21■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 STK38Q15208 465 aa25.21■■□□□ 1.63
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC192P0DO97 292 aa25.2■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.2■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 SMC2O95347 1197 aa25.2■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 TIAM1Q13009 1591 aa25.2■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 CDK19Q9BWU1 502 aa25.19■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 CABP1Q9NZU7 370 aa25.19■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 FYB1O15117 783 aa25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCE1Q969G3 411 aa25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 EPS15P42566 896 aa25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 KRT85P78386 507 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 DAPK1P53355 1430 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 TXLNAP40222 546 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC184Q52MB2 194 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 FCHSD2O94868 740 aa25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 SLFN5Q08AF3 891 aa25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 CAGE1Q8TC20 777 aa25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-201ENST00000284617 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 MCM4P33991 863 aa25.14■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2B1P20020 1258 aa25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms