RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 MNS1Q8NEH6 495 aa15.49■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 IL27Q8NEV9 243 aa15.49■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 TRIM5Q9C035 493 aa15.49■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.48■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 GNAI2P04899 355 aa15.48■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.48■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 RABEP1Q15276 862 aa15.47■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 SIL1Q9H173 461 aa15.47■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 GCC1Q96CN9 775 aa15.47■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.47■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 CDK19Q9BWU1 502 aa15.46■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.46■□□□□ 0.07
RALGPS1-201ENST00000259351 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.46■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 STK3Q13188 491 aa15.46■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 SKAP1Q86WV1 359 aa15.45■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 MBD3O95983 291 aa15.45■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 OLFM4Q6UX06 510 aa15.45■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 KINO60870 393 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 SPC24Q8NBT2 197 aa15.44■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.44■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.44■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 TSPY26PQ9H489 355 aa15.43■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 SMC2O95347 1197 aa15.43■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 TEX35Q5T0J7 233 aa15.43■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.42■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.42■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 STRN4Q9NRL3 753 aa15.42■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.41■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 MCM2P49736 904 aa15.41■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.41■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 PDCP20941 246 aa15.41■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.41■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.41■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 FBXO3Q9UK99 471 aa15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 HFM1A2PYH4 1435 aa15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 WDR63Q8IWG1 891 aa15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 MYL6BP14649 208 aa15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 XBP1P17861 261 aa15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.4■□□□□ 0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 OFD1O75665 1012 aa15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 STK38Q15208 465 aa15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 WDR97A6NE52 1622 aa15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 KLHL34Q8N239 644 aa15.39■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ERBINQ96RT1 1412 aa15.38■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 RUFY1Q96T51 708 aa15.38■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.38■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SRGAP3O43295 1099 aa15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SYNJ1O43426 1573 aa15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 HIP1O00291 1037 aa15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 MIS18AQ9NYP9 233 aa15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SYNJ2O15056 1496 aa15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.37■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 HSP90B2PQ58FF3 399 aa15.36■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 RAPGEF3O95398 923 aa15.36■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.36■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 EPS15P42566 896 aa15.36■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.36■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CAGE1Q8TC20 777 aa15.35■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 GRIN2BQ13224 1484 aa15.35■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ME1P48163 572 aa15.35■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.35■□□□□ 0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms