RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 ATP2B4P23634 1241 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 SCNN1AP37088 669 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 FUT2Q10981 343 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 PROX2Q3B8N5 592 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 LHX6Q9UPM6 363 aa9.33□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 ZBBXA8MT70 800 aa9.32□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.31□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 METRNQ9UJH8 293 aa9.31□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 DESI1Q6ICB0 168 aa9.3□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.3□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 RASA1P20936 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.29□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.29□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 HAX1O00165 279 aa9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 RECKO95980 971 aa9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 NCOA4Q13772 614 aa9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 LYPD8Q6UX82 237 aa9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 RETREG3Q86VR2 466 aa9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 DRC1Q96MC2 740 aa9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MDM2-201ENST00000258148 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.27□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.27□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 ATP6V1AP38606 617 aa9.26□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 DOK7Q18PE1 504 aa9.26□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.26□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.26□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 GABBR2O75899 941 aa9.25□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 DPYDQ12882 1025 aa9.25□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.25□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 CFHP08603 1231 aa9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 DKK1O94907 266 aa9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.24□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 CLDN10P78369 228 aa9.23□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 KCNH2Q12809 1159 aa9.23□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.23□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.23□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 ECM1Q16610 540 aa9.22□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 OCLNQ16625 522 aa9.22□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 OGFOD1Q8N543 542 aa9.22□□□□□ -0.93
MDM2-201ENST00000258148 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 RNF135Q8IUD6 432 aa9.21□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.21□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 H3BRB1 525 aa9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 ICMTO60725 284 aa9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 MORN1Q5T089 497 aa9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 RIMBP2O15034 1052 aa9.19□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.19□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 SPATA32Q96LK8 384 aa9.19□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 ASB16Q96NS5 453 aa9.19□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 KCNK17Q96T54 332 aa9.19□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 MAP10Q9P2G4 905 aa9.19□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.19□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.19□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 PRMT3O60678 531 aa9.18□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 UBXN4Q92575 508 aa9.18□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 ABL1P00519 1130 aa9.17□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 SIX5Q8N196 739 aa9.17□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.17□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 COL19A1Q14993 1142 aa9.16□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 EML3Q32P44 896 aa9.16□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.16□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.16□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 MAPK1P28482 360 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 Q3C1V9 767 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.15□□□□□ -0.94
MDM2-201ENST00000258148 C21orf2O43822 256 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms