RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ttc21bQ0HA38 1315 aa24.68■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CastP51125 788 aa24.68■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kidins220E9Q9B7 1793 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rims1Q99NE5 1463 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kif3bQ61771 747 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hfm1D3Z4R1 1434 aa24.65■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AatkQ80YE4 1365 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc60Q8C4J0 545 aa24.64■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DnmbpQ6TXD4 1580 aa24.64■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Myo5cE9Q1F5 1742 aa24.64■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Adgrl1Q80TR1 1466 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tpm2P58774 284 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nutm1Q8BHP2 1126 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ttc37F8VPK0 1563 aa24.61■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vsig10D3YX43 558 aa24.61■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stag3O70576 1240 aa24.6■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Iqgap3F8VQ29 1632 aa24.6■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 GorabQ8BRM2 368 aa24.6■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa24.6■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Efcab6Q6P1E8 1516 aa24.58■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmx3Q8BXZ1 456 aa24.58■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 FanciQ8K368 1330 aa24.58■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa24.58■■□□□ 1.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abca8aQ8K442 1620 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abca9Q8K449 1623 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 InsrP15208 1372 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hecw2Q6I6G8 1578 aa24.57■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ankrd50F7BE84 1390 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdr63B2RY71 923 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ripk4Q9ERK0 786 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Uggt1Q6P5E4 1551 aa24.55■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Erbb4Q61527 1308 aa24.55■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bloc1s4Q8VED2 215 aa24.55■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bag4Q8CI61 457 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abca6Q8K441 1624 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nek4Q9Z1J2 792 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fndc1E9Q043 1732 aa24.52■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nectin2P32507 530 aa24.52■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Erich6bQ9D4S6 220 aa24.52■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Irf5P56477 497 aa24.52■■□□□ 1.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wwc1Q5SXA9 1104 aa24.51■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa24.51■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cavin4A2AMM0 362 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Casq1O09165 405 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ino80Q6ZPV2 1559 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 VgfQ0VGU4 617 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmco5bQ80X59 307 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cetn4Q8K4K1 168 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 LifrP42703 1092 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Naip7Q9JIB3 1402 aa24.48■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trpm1Q2TV84 1622 aa24.48■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MaddQ80U28 1577 aa24.47■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Depdc5P61460 1591 aa24.47■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Skint5A7XUY5 1461 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kiaa0556Q8C753 1610 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ciz1Q8VEH2 845 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pik3r4Q8VD65 1358 aa24.45■■□□□ 1.51
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PalldQ9ET54 1408 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nos1Q9Z0J4 1429 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rasa1E9PYG6 1038 aa24.44■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 EngaseQ8BX80 734 aa24.44■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q3UPC7 1272 aa24.44■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mknk2Q8CDB0 459 aa24.44■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa24.44■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PtmaP26350 111 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pdcl2Q78Y63 240 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MvpQ9EQK5 861 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gse1Q3U3C9 1213 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa24.42■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zranb1Q7M760 708 aa24.42■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ush1cQ9ES64 910 aa24.42■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CenpjQ569L8 1344 aa24.41■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AU022751B1B0V2 589 aa24.41■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 IqubQ8CDK3 788 aa24.41■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa24.41■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa24.41■■□□□ 1.5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ecm2Q5FW85 670 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.2 ms