RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	GANC	Q8TET4	914 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	RLN3	Q8WXF3	142 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	PIGK	Q92643	395 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	ACOX2	Q99424	681 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	RTKN	Q9BST9	563 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-231	ENST00000496246	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MEI4	A8MW99	385 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DCLK1	O15075	740 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TPM1	P09493	284 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFV2	P19404	249 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP8	P22894	467 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CD6	P30203	668 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXD12	P35452	270 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH4	P55283	916 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	UBASH3A	P57075	661 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FUT11	Q495W5	492 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	KDM1B	Q8NB78	822 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	NPY6R	Q99463	290 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PQF6	199 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	WASH3P	C4AMC7	463 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PAGE1	O75459	146 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CD70	P32970	193 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CSK	P41240	450 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCR3	P49682	368 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	FMO1	Q01740	532 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CENPC	Q03188	943 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SYT12	Q8IV01	421 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GTH6	734 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	CFI	P05156	583 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RHOC	P08134	193 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SYP	P08247	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	GPD1	P21695	349 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	ETFB	P38117	255 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-231	ENST00000496246	SGSH	P51688	502 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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