RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021273.12

Vamp2-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp2, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Atg7Q9D906 698 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Ccdc22Q9JIG7 627 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Krt27Q9Z320 448 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Znf536Q8K083 1302 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Slc4a11A2AJN7 862 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 MipepA6H611 711 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Cyp2t4E9PWV0 503 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Gm8882E9Q7E4 283 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Serpinb9O08797 374 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 AlplP09242 524 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Ranbp9P69566 653 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Serping1P97290 504 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Gata5P97489 404 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Fmo3P97501 534 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Zfp759Q7M6X3 721 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Slc2a12Q8BFW9 622 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Lrch3Q8BVU0 778 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 AA792892Q8C6S1 278 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Acvr1cQ8K348 493 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Etv3Q8R4Z4 513 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Alg9Q8VDI9 611 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 MiosQ8VE19 875 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Pde6cQ91ZQ1 861 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Lrp8Q924X6 996 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Ier5lQ99J55 406 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Chst12Q99LL3 419 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 ParvbQ9ES46 365 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Trpv2Q9WTR1 756 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa14.65□□□□□ -0.06
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Vmn2r121A2BE32 847 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Kpna7C0LLJ0 499 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Raph1F2Z3U3 1266 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Chil3O35744 398 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Gpr25P0C5I1 358 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Gsta4P24472 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Msx3P70354 204 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Pdss1Q33DR2 409 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Entpd7Q3TCT4 606 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Prmt9Q3U3W5 846 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Mkl1Q8K4J6 964 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Eml3Q8VC03 897 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Dhx36Q8VHK9 1001 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 B4galt3Q91YY2 395 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 AadacQ99PG0 398 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Pex10B1AUE5 324 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Arhgap42B2RQE8 841 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Cyp2b23E9Q593 491 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Atf6F6VAN0 656 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Abhd12bG3UZN6 359 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Pdcd1Q02242 288 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Smpd1Q04519 627 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Zbtb48Q1H9T6 681 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Q3TQQ9 903 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 McuQ3UMR5 350 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Gm8773Q3UQ24 132 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Bcar1Q61140 874 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Mettl21cQ8BLU2 248 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Rcn2Q8BP92 320 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Tfb1mQ8JZM0 345 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Tekt2Q922G7 430 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Capn7Q9R1S8 813 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 ThadaA8C756 1938 aa14.64□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Serpina3iD3Z450 408 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Gm6205E9PZS2 359 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Tekt5G5E8A8 557 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Soat2O88908 525 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Pde6bP23440 856 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 NcanP55066 1268 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Scube3Q66PY1 993 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Hmgb4Q6P8W9 181 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Wscd1Q80XH4 572 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Dis3lQ8C0S1 1053 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Gm6367Q8C6L9 287 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Ca12Q8CI85 354 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Olfr784Q8VFZ9 319 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 TraipQ8VIG6 470 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Wrnip1Q91XU0 660 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Pex6Q99LC9 981 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 ClcnkbQ9WUB6 687 aa14.63□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa14.62□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa14.62□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Zfp358E9Q8M1 571 aa14.62□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Itgb3O54890 787 aa14.62□□□□□ -0.07
Vamp2-201ENSMUST00000021273 Pim1P06803 397 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.5 ms