Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Itgb3O54890 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Itgb3O54890 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Itgb3O54890 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Itgb3O54890 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Itgb3O54890 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Itgb3O54890 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Itgb3O54890 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Itgb3O54890 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Itgb3O54890 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Itgb3O54890 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Itgb3O54890 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Itgb3O54890 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Itgb3O54890 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Itgb3O54890 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Itgb3O54890 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Itgb3O54890 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Itgb3O54890 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Itgb3O54890 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Itgb3O54890 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Itgb3O54890 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Itgb3O54890 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Itgb3O54890 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Itgb3O54890 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Itgb3O54890 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Itgb3O54890 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Itgb3O54890 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Itgb3O54890 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Itgb3O54890 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Itgb3O54890 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Itgb3O54890 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Itgb3O54890 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Itgb3O54890 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Itgb3O54890 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Itgb3O54890 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Itgb3O54890 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Itgb3O54890 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Itgb3O54890 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Itgb3O54890 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Itgb3O54890 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Itgb3O54890 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Itgb3O54890 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Itgb3O54890 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Itgb3O54890 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Itgb3O54890 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Itgb3O54890 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Itgb3O54890 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Itgb3O54890 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Itgb3O54890 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Itgb3O54890 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Itgb3O54890 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Itgb3O54890 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Itgb3O54890 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Itgb3O54890 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Itgb3O54890 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Itgb3O54890 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Itgb3O54890 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Itgb3O54890 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Itgb3O54890 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Itgb3O54890 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Itgb3O54890 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Itgb3O54890 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Itgb3O54890 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Itgb3O54890 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Itgb3O54890 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Itgb3O54890 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Itgb3O54890 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Itgb3O54890 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Itgb3O54890 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Itgb3O54890 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Itgb3O54890 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Itgb3O54890 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Itgb3O54890 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Itgb3O54890 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Itgb3O54890 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Itgb3O54890 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Itgb3O54890 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Itgb3O54890 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Itgb3O54890 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Itgb3O54890 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Itgb3O54890 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Itgb3O54890 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Itgb3O54890 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Itgb3O54890 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Itgb3O54890 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Itgb3O54890 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Itgb3O54890 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Itgb3O54890 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Itgb3O54890 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Itgb3O54890 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Itgb3O54890 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Itgb3O54890 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Itgb3O54890 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Itgb3O54890 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Itgb3O54890 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Itgb3O54890 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Itgb3O54890 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Itgb3O54890 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itgb3O54890 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itgb3O54890 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms