Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kpna7C0LLJ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Kpna7C0LLJ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kpna7C0LLJ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kpna7C0LLJ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Kpna7C0LLJ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Kpna7C0LLJ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Kpna7C0LLJ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Kpna7C0LLJ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kpna7C0LLJ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kpna7C0LLJ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kpna7C0LLJ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kpna7C0LLJ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kpna7C0LLJ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Kpna7C0LLJ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Kpna7C0LLJ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Kpna7C0LLJ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kpna7C0LLJ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Kpna7C0LLJ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kpna7C0LLJ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kpna7C0LLJ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Kpna7C0LLJ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kpna7C0LLJ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kpna7C0LLJ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kpna7C0LLJ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kpna7C0LLJ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kpna7C0LLJ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kpna7C0LLJ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Kpna7C0LLJ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kpna7C0LLJ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kpna7C0LLJ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kpna7C0LLJ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kpna7C0LLJ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kpna7C0LLJ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kpna7C0LLJ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kpna7C0LLJ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kpna7C0LLJ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kpna7C0LLJ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kpna7C0LLJ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kpna7C0LLJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kpna7C0LLJ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kpna7C0LLJ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kpna7C0LLJ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kpna7C0LLJ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Kpna7C0LLJ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kpna7C0LLJ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Kpna7C0LLJ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kpna7C0LLJ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kpna7C0LLJ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kpna7C0LLJ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kpna7C0LLJ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kpna7C0LLJ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kpna7C0LLJ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kpna7C0LLJ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kpna7C0LLJ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kpna7C0LLJ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kpna7C0LLJ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kpna7C0LLJ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Kpna7C0LLJ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kpna7C0LLJ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kpna7C0LLJ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Kpna7C0LLJ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kpna7C0LLJ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kpna7C0LLJ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kpna7C0LLJ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kpna7C0LLJ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kpna7C0LLJ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kpna7C0LLJ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kpna7C0LLJ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kpna7C0LLJ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kpna7C0LLJ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kpna7C0LLJ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kpna7C0LLJ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kpna7C0LLJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kpna7C0LLJ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kpna7C0LLJ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kpna7C0LLJ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kpna7C0LLJ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kpna7C0LLJ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kpna7C0LLJ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kpna7C0LLJ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kpna7C0LLJ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kpna7C0LLJ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kpna7C0LLJ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Kpna7C0LLJ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kpna7C0LLJ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kpna7C0LLJ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kpna7C0LLJ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kpna7C0LLJ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kpna7C0LLJ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kpna7C0LLJ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kpna7C0LLJ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kpna7C0LLJ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kpna7C0LLJ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kpna7C0LLJ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kpna7C0LLJ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kpna7C0LLJ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kpna7C0LLJ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms