Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gata5P97489 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Gata5P97489 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gata5P97489 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Gata5P97489 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Gata5P97489 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gata5P97489 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gata5P97489 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gata5P97489 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Gata5P97489 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gata5P97489 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gata5P97489 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gata5P97489 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gata5P97489 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gata5P97489 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Gata5P97489 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gata5P97489 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gata5P97489 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Gata5P97489 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gata5P97489 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gata5P97489 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gata5P97489 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gata5P97489 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gata5P97489 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Gata5P97489 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gata5P97489 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gata5P97489 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gata5P97489 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gata5P97489 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gata5P97489 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gata5P97489 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gata5P97489 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gata5P97489 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gata5P97489 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gata5P97489 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gata5P97489 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gata5P97489 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gata5P97489 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gata5P97489 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Gata5P97489 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gata5P97489 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gata5P97489 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gata5P97489 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gata5P97489 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gata5P97489 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gata5P97489 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gata5P97489 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gata5P97489 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gata5P97489 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gata5P97489 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gata5P97489 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gata5P97489 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gata5P97489 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gata5P97489 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gata5P97489 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gata5P97489 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gata5P97489 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gata5P97489 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gata5P97489 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gata5P97489 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gata5P97489 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gata5P97489 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gata5P97489 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gata5P97489 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gata5P97489 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gata5P97489 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gata5P97489 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gata5P97489 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gata5P97489 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gata5P97489 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gata5P97489 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gata5P97489 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gata5P97489 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gata5P97489 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gata5P97489 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gata5P97489 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gata5P97489 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gata5P97489 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gata5P97489 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gata5P97489 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gata5P97489 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gata5P97489 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gata5P97489 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Gata5P97489 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gata5P97489 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gata5P97489 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gata5P97489 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gata5P97489 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gata5P97489 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gata5P97489 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gata5P97489 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gata5P97489 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gata5P97489 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gata5P97489 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gata5P97489 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gata5P97489 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gata5P97489 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gata5P97489 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gata5P97489 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gata5P97489 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms