RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489842.1

GTF3C5-210, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 696 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-210ENST00000489842 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 HESX1Q9UBX0 185 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 AP5Z1O43299 807 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 NUCB2P80303 420 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 LRRC63Q05C16 580 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TAF5Q15542 800 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 LAYNQ6UX15 382 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CHST9Q7L1S5 443 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 C11orf74Q86VG3 221 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CPXM2Q8N436 756 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 RNF139Q8WU17 664 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PLD4Q96BZ4 506 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TIGD1Q96MW7 591 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 DCLK3Q9C098 648 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 IL21RQ9HBE5 538 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CAPN10Q9HC96 672 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 WASF3Q9UPY6 502 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM131Q92545 1883 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 USP24Q9UPU5 2620 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 KCNK3O14649 394 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PSMA7O14818 248 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TBL1XO60907 577 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 NDUFS2O75306 463 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 EPHX1P07099 455 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 NCAM1P13591 858 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 KRT5P13647 590 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CD59P13987 128 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC9A1P19634 815 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CHKAP35790 457 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TPMTP51580 245 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF132P52740 706 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 BNC1Q01954 994 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ENPP2Q13822 863 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 BECN1Q14457 450 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CNGA2Q16280 664 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PTPRNQ16849 979 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 FSCBQ5H9T9 825 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 CEP63Q96MT8 703 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C5-210ENST00000489842 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms