RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 KLHL2O95198 593 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 C22orf31O95567 290 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PGK1P00558 417 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 F9P00740 461 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PIGRP01833 764 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 KRT16P08779 473 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 GFAPP14136 432 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SERPINB5P36952 375 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 NR2C2P49116 596 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 NCALDP61601 193 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CHSY1Q86X52 802 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 BHMTQ93088 406 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 NAT9Q9BTE0 207 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 GPR182O15218 404 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 LTFP02788 710 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 LAYNQ6UX15 382 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 VSTM1Q6UX27 236 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ILDR2Q71H61 639 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 EFHBQ8N7U6 833 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 WNT8BQ93098 351 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 A0A0A0MRY4 1105 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 A8MUI8 341 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 FBXO21O94952 628 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 UNC5CO95185 931 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 NPR3P17342 541 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CALB2P22676 271 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 COPAP53621 1224 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 BST1Q10588 318 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 EFEMP1Q12805 493 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 FITM2Q8N6M3 262 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SPATA13Q96N96 652 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 KAT6AQ92794 2004 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM63AO94886 807 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MT-CO1P00395 513 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 NOS2P35228 1153 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 GP5P40197 560 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SERPINB8P50452 374 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CA9Q16790 459 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ANO4Q32M45 955 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CCNJLQ8IV13 435 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TRIM4Q9C037 500 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 RRAGCQ9HB90 399 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TPP1O14773 563 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PPEF2O14830 753 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CLGNO14967 610 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TREHO43280 583 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MMP3P08254 477 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ALADP13716 330 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 KCNA3P22001 575 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TRIP10Q15642 601 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 HSFY1Q96LI6 401 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 APBA2Q99767 749 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF670Q9BS34 389 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 C2CD2LO14523 706 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SH3BP5O60239 455 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ANXA9O76027 345 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.3 ms