RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 GON4LQ3T8J9 2241 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 EPN2O95208 641 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 NTSR1P30989 418 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 GBP1P32455 592 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 WASP42768 502 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 RPL34P49207 117 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 ELF2Q15723 593 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 CSRP2Q16527 193 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 VWA3BQ502W6 1294 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 MIIPQ5JXC2 388 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 GPT2Q8TD30 523 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 DDI1Q8WTU0 396 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 HMGB4Q8WW32 186 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 SHC3Q92529 594 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC4A5Q9BY07 1137 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 SIX2Q9NPC8 291 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC12Q9UKB3 198 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP192Q8TEP8 1941 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNJ18B7U540 433 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PES1O00541 588 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 SART1O43290 800 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 RHOBTB1O94844 696 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 NCAM1P13591 858 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXB2P14652 356 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP8P85298 464 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNJ12Q14500 433 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 SDE2Q6IQ49 451 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR23CQ6ZRP0 262 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CHPFQ8IZ52 775 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PGBD3Q8N328 593 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 STK32AQ8WU08 396 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM149B1Q96BN6 582 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 ACOX2Q99424 681 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CYTH4Q9UIA0 394 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPAN3O60637 253 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 LATS1O95835 1130 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC6Q16204 474 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 MPPE1Q53F39 396 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRF1Q5T601 910 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 C11orf74Q86VG3 221 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 OLIG1Q8TAK6 271 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 RLN3Q8WXF3 142 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 DLL3Q9NYJ7 618 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 STOML2Q9UJZ1 356 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CLEC4EQ9ULY5 219 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 E5RJQ4 531 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV3-27P01718 113 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 FYNP06241 537 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 SDHBP21912 280 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 BCKDHBP21953 392 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 TBX4P57082 545 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF445P59923 1031 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PTK2Q05397 1052 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 GEN1Q17RS7 908 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 NUGGCQ68CJ6 796 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM110Q86TL2 294 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 UNC45BQ8IWX7 931 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC2A11Q9BYW1 496 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 DCHS1Q96JQ0 3298 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 DMXL1Q9Y485 3027 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PI4KAP42356 2102 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PQF6 199 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 GFRA2O00451 464 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 CAPN9O14815 690 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 GABRG2P18507 467 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 MPLP40238 635 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 P2RY2P41231 377 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC11A2P49281 568 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 RING1Q06587 406 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNMA1Q12791 1236 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 PDCLQ13371 301 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-211ENST00000493436 TCP11X2Q5H9J9 407 aa17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms