RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532872.5

RPS3-218, Transcript of ribosomal protein S3, human

TSL 3

Gene RPS3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS3-218	ENST00000532872	ZBED1	O96006	694 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	KLKB1	P03952	638 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CISD3	P0C7P0	127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CD19	P15391	556 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	FMO5	P49326	533 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PDE4C	Q08493	712 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CHPF	Q8IZ52	775 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	BHMT	Q93088	406 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PLK2	Q9NYY3	685 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872		A0A1W2PQF6	199 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	LNP1	A1A4G5	178 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	TULP2	O00295	520 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	GFRA2	O00451	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PMM2	O15305	246 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	HMBS	P08397	361 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	VDR	P11473	427 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	GABRG2	P18507	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	KCNA4	P22459	653 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	WAS	P42768	502 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	LRMP	Q12912	555 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	UBR7	Q8N806	425 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PIGK	Q92643	395 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PLD4	Q96BZ4	506 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	ACOX2	Q99424	681 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	GABRG3	Q99928	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	ACACB	O00763	2458 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872		O00370	1275 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	AP5Z1	O43299	807 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CYBB	P04839	570 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PAEP	P09466	180 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	DPP6	P42658	865 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PTGER3	P43115	390 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CETN1	Q12798	172 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	P2RY11	Q96G91	374 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	CD248	Q9HCU0	757 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	NPC1	O15118	1278 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	P4HA2	O15460	535 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	ZNF217	O75362	1048 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	NDUFV2	P19404	249 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	BMP6	P22004	513 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	MFAP3	P55082	362 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	IRX4	P78413	519 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS3-218	ENST00000532872	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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