RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF139	Q8WU17	664 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	GMIP	Q9P107	970 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC188	H7C350	402 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	IRAK2	O43187	625 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF19	O95750	216 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	F11	P03951	625 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CTAGE8	P0CG41	777 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	RARG	P13631	454 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	IL4R	P24394	825 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR7	P34969	479 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	IRS1	P35568	1242 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	MYH10	P35580	1976 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNC3	Q14003	757 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC181	Q5TID7	509 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	RAPGEF5	Q92565	580 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TSC1	Q92574	1164 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	EDEM1	Q92611	657 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	FGG	P02679	453 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	LRG1	P02750	347 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	C8A	P07357	584 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	L1CAM	P32004	1257 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CCR1	P32246	355 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TAF12	Q16514	161 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	CDO1	Q16878	200 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMB7	Q99436	277 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
TRAF4-208	ENST00000469529	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.25	□□□□□ -0.29

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