RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 PKDCCQ504Y2 493 aa27.96■■■□□ 2.07
ODC1-204ENST00000446285 EHBP1Q8NDI1 1231 aa27.96■■■□□ 2.07
ODC1-204ENST00000446285 OLIG1Q8TAK6 271 aa27.96■■■□□ 2.07
ODC1-204ENST00000446285 PLD4Q96BZ4 506 aa27.96■■■□□ 2.07
ODC1-204ENST00000446285 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
ODC1-204ENST00000446285 TPSD1Q9BZJ3 242 aa27.96■■■□□ 2.07
ODC1-204ENST00000446285 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.96■■■□□ 2.07
ODC1-204ENST00000446285 KIAA1468Q9P260 1216 aa27.96■■■□□ 2.07
ODC1-204ENST00000446285 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 TULP2O00295 520 aa27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 KLKB1P03952 638 aa27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 DGKGP49619 791 aa27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CNGA2Q16280 664 aa27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 PMS2CLQ68D20 193 aa27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 SPACA7Q96KW9 195 aa27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 ABCA7Q8IZY2 2146 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 THADAQ6YHU6 1953 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 SLC12A8A0AV02 714 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 DCLK1O15075 740 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 PENKP01210 267 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 NTSR1P30989 418 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 LIMK1P53667 647 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 SDE2Q6IQ49 451 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 BHLHA9Q7RTU4 235 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CPXM2Q8N436 756 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 UBA3Q8TBC4 463 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 RNF139Q8WU17 664 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 RWDD2AQ9UIY3 292 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 FBXO10Q9UK96 956 aa27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 NUP205Q92621 2012 aa27.93■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CYBBP04839 570 aa27.93■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 IRGQQ8WZA9 623 aa27.93■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 TFAP2BQ92481 460 aa27.93■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 ABCC13Q9NSE7 274 aa27.93■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa27.93■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 TRIM24O15164 1050 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 HMBSP08397 361 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CISD3P0C7P0 127 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 HOXB2P14652 356 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 ZNF132P52740 706 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 E2F5Q15329 346 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 BSPRYQ5W0U4 402 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 SLC35F5Q8WV83 523 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 KAT5Q92993 513 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 HSFY1Q96LI6 401 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 FAM81BQ96LP2 452 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 NCOR2Q9Y618 2525 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 M0QYV0 167 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 P2RY2P41231 377 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 HARS2P49590 506 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 DAOAP59103 153 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 ZNF445P59923 1031 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CREB5Q02930 508 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 FYB2Q5VWT5 728 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 RRAGAQ7L523 313 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 DENND1CQ8IV53 801 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 FMNL3Q8IVF7 1028 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 FAM217AQ8IXS0 508 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CHPFQ8IZ52 775 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 HMGB4Q8WW32 186 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CNTN6Q9UQ52 1028 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 SPTBN2O15020 2390 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 GFRA2O00451 464 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 NPC1O15118 1278 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 LATS1O95835 1130 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 SPDYCQ5MJ68 293 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF19Q8IW93 802 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 PGBD3Q8N328 593 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 GABRG3Q99928 467 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 PLK2Q9NYY3 685 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 HCN2Q9UL51 889 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 INVSQ9Y283 1065 aa27.9■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 YJEFN3A6XGL0 299 aa27.89■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 PRRT4C9JH25 899 aa27.89■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 E7ENQ6 273 aa27.89■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 FBXO21O94952 628 aa27.89■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 CAVIN2O95810 425 aa27.89■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 LCP1P13796 627 aa27.89■■■□□ 2.06
ODC1-204ENST00000446285 BRD2P25440 801 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms