RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	FZD5	Q13467	585 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	EOGT	Q5NDL2	527 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf74	Q86VG3	221 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SCML4	Q8N228	414 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RUBCN	Q92622	972 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	COL4A2	P08572	1712 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KAT7	O95251	611 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	APBB3	O95704	486 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC9A1	P19634	815 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXA6	P31267	233 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC11A2	P49281	568 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC13	P55735	322 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf27A	Q580R0	203 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZS52	159 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	UBR7	Q8N806	425 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KAT5	Q92993	513 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MDM4	O15151	490 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	LTF	P02788	710 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	NCAM1	P13591	858 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TYR	P14679	529 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PON1	P27169	355 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	GBP1	P32455	592 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DGKG	P49619	791 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DGKE	P52429	567 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF132	P52740	706 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DAOA	P59103	153 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ZXDB	P98169	803 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MYL5	Q02045	173 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KDSR	Q06136	332 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MTA1	Q13330	715 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DMC1	Q14565	340 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SYCP1	Q15431	976 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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