RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.87■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SOBPA7XYQ1 873 aa22.87■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 COCHO43405 550 aa22.87■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 OLFM2O95897 454 aa22.87■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC175P0C221 793 aa22.87■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.87■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.87■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SLC22A12Q96S37 553 aa22.87■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.86■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.85■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MDM4O15151 490 aa22.85■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GPD1P21695 349 aa22.85■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.85■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.84■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADAM32Q8TC27 787 aa22.84■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.84■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.84■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.256e-9■■■□□ 17.7
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.84■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.84■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CDH7Q9ULB5 785 aa22.84■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.84■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DPYSL4O14531 572 aa22.83■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.83■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.83■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BTBD6Q96KE9 485 aa22.83■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MYADMQ96S97 322 aa22.83■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RRN3Q9NYV6 651 aa22.83■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.83■■□□□ 1.25
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.83■■□□□ 1.25
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 AVPR1AP37288 418 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SLC7A9P82251 487 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TFF2Q03403 129 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MIB1Q86YT6 1006 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TBCBQ99426 244 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.82■■□□□ 1.24
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 M0QYT0 321 aa22.82■■□□□ 1.24
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