RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 UNGP13051 313 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 CTHP32929 405 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 NOMO3P69849 1222 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TXNDC11Q6PKC3 985 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TTC30AQ86WT1 665 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 PASD1Q8IV76 773 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TMEM35BQ8NCS4 154 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 KCNK16Q96T55 309 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 GKN1Q9NS71 199 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 EHD2Q9NZN4 543 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 HESX1Q9UBX0 185 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 CEP83Q9Y592 693 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 M0QYV0 167 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 ZNF292O60281 2723 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 ATP8B3O60423 1300 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 CKMP06732 381 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 USP17L7P0C7H9 530 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 SP9P0CG40 484 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 ADORA2BP29275 332 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 GPD2P43304 727 aa19.17■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF77Q15935 545 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa19.17■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 MED10Q9BTT4 135 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 HPS4Q9NQG7 708 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa19.17■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 ZNF840PA6NDX5 716 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 GFRA3O60609 400 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 CHRNB1P11230 501 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TAF10Q12962 218 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 USP4Q13107 963 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 MTAPQ13126 283 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 SPA17Q15506 151 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 CCDC122Q5T0U0 273 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 C10orf76Q5T2E6 689 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 C1orf228Q6PIY5 440 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 NUP93Q8N1F7 819 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TAS2R14Q9NYV8 317 aa19.16■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 TNFRSF10BO14763 440 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 AP1G2O75843 785 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 FAM200BP0CF97 657 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 HDCP19113 662 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 PPP3CCP48454 512 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 KRT83P78385 493 aa19.15■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 BST2Q10589 180 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 ACAD10Q6JQN1 1059 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 ASCL5Q7RTU5 278 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 SLC35F5Q8WV83 523 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 CHFRQ96EP1 664 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 SMOQ99835 787 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 DESI2Q9BSY9 194 aa19.15■□□□□ 0.66
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PTX4-201ENST00000293922 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 KRT82Q9NSB4 513 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 CYTH4Q9UIA0 394 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 FBXO4Q9UKT5 387 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 PYCARDQ9ULZ3 195 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 R4GN57 208 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 PATJQ8NI35 1801 aa19.15■□□□□ 0.66
PTX4-201ENST00000293922 PRR23AA6NEV1 266 aa19.14■□□□□ 0.65
PTX4-201ENST00000293922 RTN2O75298 545 aa19.14■□□□□ 0.65
PTX4-201ENST00000293922 ARSAP15289 507 aa19.14■□□□□ 0.65
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