RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXA2O43364 376 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL4RP24394 825 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADCY8P40145 1251 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMRN1Q13201 1228 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASD1Q96PB1 797 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HIPK3Q9H422 1215 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VWA8A3KMH1 1905 aa22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRP1O14786 923 aa22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SULT1E1P49888 294 aa22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF6Q58WW2 860 aa22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRGQQ8WZA9 623 aa22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLAAQ9Y263 795 aa22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYN3O14994 580 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBED1O96006 694 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BDNFP23560 247 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAAP100Q0VG06 881 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLMAPQ14BN4 828 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCTN1Q2MV58 587 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM209Q96SK2 561 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H0YGN5 161 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF40O75150 1001 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FYNP06241 537 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 L1CAMP32004 1257 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CA9Q16790 459 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRN3Q9NYV6 651 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFS1Q9Y697 457 aa22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E7ENQ6 273 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TGM2P21980 687 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDR1P51861 262 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGA8P53708 1063 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PMS2P54278 862 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOMO1Q15155 1222 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDC80O14777 642 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCF2LO15068 1137 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TADA2AO75478 443 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RARGP13631 454 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC185Q8N715 623 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PQLC3Q8N755 202 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB9Q96C00 473 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCLYQ96I15 445 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC9A7Q96T83 725 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP3Q9Y6I4 520 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOL1O14791 398 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LTFP02788 710 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L7P0C7H9 530 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RABGGTBP53611 331 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TLE2Q04725 743 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms