RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		1.09	□□□□□ -2.23
YLR224W	YLR224W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		1.08	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		1.08	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		1.07	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		1.07	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		1.07	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	HHY1	P39982	102 aa		1.06	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	1.06	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		1.05	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	HUA1	P40325	198 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YLR224W	YLR224W	RPC10	P40422	70 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	TOS6	P48560	102 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	YGR025W	P53216	100 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		1	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	AUA1	P32450	94 aa		1	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		1	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	RPS27B	P38711	82 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	OLI1	P61829	76 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YLR224W	YLR224W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	YBR016W	P38216	128 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	COA2	Q3E823	68 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	BPH1	P25356	2167 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	YBL044W	P38194	122 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	BLM10	P43583	2143 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	COX9	P07255	59 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	YCR108C	Q3E819	63 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YLR224W	YLR224W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YLR224W	YLR224W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YLR224W	YLR224W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YLR224W	YLR224W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YLR224W	YLR224W	SIP18	P50263	79 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YLR224W	YLR224W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YLR224W	YLR224W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YLR224W	YLR224W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YLR224W	YLR224W	DDR2	P89113	61 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YLR224W	YLR224W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YLR224W	YLR224W	TOM7	P53507	60 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YLR224W	YLR224W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YLR224W	YLR224W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YLR224W	YLR224W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
YLR224W	YLR224W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YLR224W	YLR224W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YLR224W	YLR224W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YLR224W	YLR224W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YLR224W	YLR224W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YLR224W	YLR224W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR224W	YLR224W	HOR7	Q05827	59 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YLR224W	YLR224W	NCE101	Q02820	53 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YLR224W	YLR224W	PMP3	P87284	55 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YLR224W	YLR224W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YLR224W	YLR224W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YLR224W	YLR224W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YLR224W	YLR224W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YLR224W	YLR224W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YLR224W	YLR224W	RPL39	P04650	51 aa		0.36	□□□□□ -2.35

Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.7 ms