RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 ADGRB2O60241 1585 aa25.05■■□□□ 1.6
HERC3-214ENST00000601319 STK26Q9P289 416 aa25.05■■□□□ 1.6
HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HERC3-214ENST00000601319 JCADQ9P266 1359 aa25.04■■□□□ 1.6
HERC3-214ENST00000601319 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.03■■□□□ 1.6
HERC3-214ENST00000601319 KIF1AQ12756 1690 aa25.01■■□□□ 1.59
HERC3-214ENST00000601319 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25■■□□□ 1.59
HERC3-214ENST00000601319 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.99■■□□□ 1.59
HERC3-214ENST00000601319 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
HERC3-214ENST00000601319 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HERC3-214ENST00000601319 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.93■■□□□ 1.58
HERC3-214ENST00000601319 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.93■■□□□ 1.58
HERC3-214ENST00000601319 USP32Q8NFA0 1604 aa24.93■■□□□ 1.58
HERC3-214ENST00000601319 PRAM1Q96QH2 718 aa24.92■■□□□ 1.58
HERC3-214ENST00000601319 LRP6O75581 1613 aa24.91■■□□□ 1.58
HERC3-214ENST00000601319 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HERC3-214ENST00000601319 ILDR2Q71H61 639 aa24.9■■□□□ 1.58
HERC3-214ENST00000601319 ORAI2Q96SN7 254 aa24.9■■□□□ 1.58
HERC3-214ENST00000601319 PXDNQ92626 1479 aa24.89■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.87■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 ITSN1Q15811 1721 aa24.87■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 POGKQ9P215 609 aa24.86■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.86■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.85■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.85■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.85■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.84■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.84■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.83■■□□□ 1.57
HERC3-214ENST00000601319 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.81■■□□□ 1.56
HERC3-214ENST00000601319 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
HERC3-214ENST00000601319 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HERC3-214ENST00000601319 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.79■■□□□ 1.56
HERC3-214ENST00000601319 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HERC3-214ENST00000601319 NUTM2FA1L443 756 aa24.78■■□□□ 1.56
HERC3-214ENST00000601319 NEUROD1Q13562 356 aa24.76■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.75■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 ATP7BP35670 1465 aa24.75■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 FOXO3O43524 673 aa24.74■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 ABCA3Q99758 1704 aa24.73■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.72■■□□□ 1.55
HERC3-214ENST00000601319 ALS2Q96Q42 1657 aa24.7■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 SOCS7O14512 581 aa24.7■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 TONSLQ96HA7 1378 aa24.69■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.69■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.69■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.68■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.68■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 SBNO1A3KN83 1393 aa24.67■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.66■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 POTEAQ6S8J7 498 aa24.64■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.64■■□□□ 1.54
HERC3-214ENST00000601319 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.64■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 PSME1Q06323 249 aa24.63■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.61■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF10O15013 1369 aa24.61■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 AFF2P51816 1311 aa24.6■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.59■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 CDK19Q9BWU1 502 aa24.59■■□□□ 1.53
HERC3-214ENST00000601319 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.57■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 C8orf37Q96NL8 207 aa24.56■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.56■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.55■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.55■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 ADAMTS2O95450 1211 aa24.55■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.54■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 AKAP12Q02952 1782 aa24.52■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.52■■□□□ 1.52
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC3-214ENST00000601319 NGLY1Q96IV0 654 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC3-214ENST00000601319 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HERC3-214ENST00000601319 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.5■■□□□ 1.51
HERC3-214ENST00000601319 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HERC3-214ENST00000601319 EVC2Q86UK5 1308 aa24.49■■□□□ 1.51
HERC3-214ENST00000601319 SLIT2O94813 1529 aa24.48■■□□□ 1.51
HERC3-214ENST00000601319 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.48■■□□□ 1.51
HERC3-214ENST00000601319 ACEP12821 1306 aa24.47■■□□□ 1.51
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