RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598913.5

SAMD4B-208, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD4B, Length 2,877 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4B-208ENST00000598913 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.38■■■□□ 2.29
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SAMD4B-208ENST00000598913 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.37■■■□□ 2.29
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SAMD4B-208ENST00000598913 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.35■■■□□ 2.29
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SAMD4B-208ENST00000598913 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.33■■■□□ 2.29
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SAMD4B-208ENST00000598913 CD109Q6YHK3 1445 aa29.29■■■□□ 2.28
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SAMD4B-208ENST00000598913 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
SAMD4B-208ENST00000598913 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.26■■■□□ 2.28
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SAMD4B-208ENST00000598913 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
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SAMD4B-208ENST00000598913 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
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SAMD4B-208ENST00000598913 PDE3AQ14432 1141 aa29.19■■■□□ 2.26
SAMD4B-208ENST00000598913 CFAP53Q96M91 514 aa29.19■■■□□ 2.26
SAMD4B-208ENST00000598913 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
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SAMD4B-208ENST00000598913 EVC2Q86UK5 1308 aa29.19■■■□□ 2.26
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SAMD4B-208ENST00000598913 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.26
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SAMD4B-208ENST00000598913 SLC24A1O60721 1099 aa29.14■■■□□ 2.26
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SAMD4B-208ENST00000598913 A0A1W2PP64 1363 aa29.12■■■□□ 2.25
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SAMD4B-208ENST00000598913 USP35Q9P2H5 1018 aa29.06■■■□□ 2.24
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SAMD4B-208ENST00000598913 CDK19Q9BWU1 502 aa28.99■■■□□ 2.23
SAMD4B-208ENST00000598913 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.98■■■□□ 2.23
SAMD4B-208ENST00000598913 NGEFQ8N5V2 710 aa28.98■■■□□ 2.23
SAMD4B-208ENST00000598913 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.97■■■□□ 2.23
SAMD4B-208ENST00000598913 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.97■■■□□ 2.23
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SAMD4B-208ENST00000598913 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
SAMD4B-208ENST00000598913 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.95■■■□□ 2.23
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