RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589600.5

ILF3-216, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ILF3, Length 839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-216ENST00000589600 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.36■■■■□ 3.25
ILF3-216ENST00000589600 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.36■■■■□ 3.25
ILF3-216ENST00000589600 MST1RQ04912 1400 aa35.35■■■■□ 3.25
ILF3-216ENST00000589600 PRAM1Q96QH2 718 aa35.35■■■■□ 3.25
ILF3-216ENST00000589600 ATF3P18847 181 aa35.34■■■■□ 3.25
ILF3-216ENST00000589600 SLAIN2Q9P270 581 aa35.33■■■■□ 3.25
ILF3-216ENST00000589600 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
ILF3-216ENST00000589600 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.3■■■■□ 3.24
ILF3-216ENST00000589600 ADGRB2O60241 1585 aa35.3■■■■□ 3.24
ILF3-216ENST00000589600 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.29■■■■□ 3.24
ILF3-216ENST00000589600 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
ILF3-216ENST00000589600 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.26■■■■□ 3.24
ILF3-216ENST00000589600 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.26■■■■□ 3.24
ILF3-216ENST00000589600 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
ILF3-216ENST00000589600 POGKQ9P215 609 aa35.24■■■■□ 3.23
ILF3-216ENST00000589600 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.22■■■■□ 3.23
ILF3-216ENST00000589600 HSPA1LP34931 641 aa35.2■■■■□ 3.23
ILF3-216ENST00000589600 BRINP3Q76B58 766 aa35.17■■■■□ 3.22
ILF3-216ENST00000589600 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.15■■■■□ 3.22
ILF3-216ENST00000589600 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
ILF3-216ENST00000589600 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
ILF3-216ENST00000589600 USP32Q8NFA0 1604 aa35.14■■■■□ 3.22
ILF3-216ENST00000589600 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.13■■■■□ 3.21
ILF3-216ENST00000589600 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
ILF3-216ENST00000589600 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
ILF3-216ENST00000589600 PHLPP1O60346 1717 aa35.1■■■■□ 3.21
ILF3-216ENST00000589600 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
ILF3-216ENST00000589600 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.09■■■■□ 3.21
ILF3-216ENST00000589600 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
ILF3-216ENST00000589600 ORAI2Q96SN7 254 aa35.08■■■■□ 3.21
ILF3-216ENST00000589600 NUTM2FA1L443 756 aa35.06■■■■□ 3.2
ILF3-216ENST00000589600 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.06■■■■□ 3.2
ILF3-216ENST00000589600 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.05■■■■□ 3.2
ILF3-216ENST00000589600 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
ILF3-216ENST00000589600 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
ILF3-216ENST00000589600 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.01■■■■□ 3.19
ILF3-216ENST00000589600 KIF1AQ12756 1690 aa35■■■■□ 3.19
ILF3-216ENST00000589600 ATP7BP35670 1465 aa34.99■■■■□ 3.19
ILF3-216ENST00000589600 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.98■■■■□ 3.19
ILF3-216ENST00000589600 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
ILF3-216ENST00000589600 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.95■■■■□ 3.19
ILF3-216ENST00000589600 CDK19Q9BWU1 502 aa34.94■■■■□ 3.18
ILF3-216ENST00000589600 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.94■■■■□ 3.18
ILF3-216ENST00000589600 ITSN1Q15811 1721 aa34.92■■■■□ 3.18
ILF3-216ENST00000589600 PXDNQ92626 1479 aa34.91■■■■□ 3.18
ILF3-216ENST00000589600 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.88■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 USP47Q96K76 1375 aa34.87■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 SHPRHQ149N8 1683 aa34.86■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 FOXO3O43524 673 aa34.86■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.85■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 TESK2Q96S53 571 aa34.83■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 JCADQ9P266 1359 aa34.83■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 EVC2Q86UK5 1308 aa34.82■■■■□ 3.17
ILF3-216ENST00000589600 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.82■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 CABP2Q9NPB3 220 aa34.82■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.81■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.77■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
ILF3-216ENST00000589600 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.75■■■■□ 3.15
ILF3-216ENST00000589600 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.74■■■■□ 3.15
ILF3-216ENST00000589600 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
ILF3-216ENST00000589600 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
ILF3-216ENST00000589600 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.72■■■■□ 3.15
ILF3-216ENST00000589600 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.71■■■■□ 3.15
ILF3-216ENST00000589600 LRP6O75581 1613 aa34.69■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 SBNO1A3KN83 1393 aa34.67■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.67■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 ACEP12821 1306 aa34.67■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.67■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 ALS2Q96Q42 1657 aa34.66■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.66■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.66■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 PSME1Q06323 249 aa34.66■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.65■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 CABP1Q9NZU7 370 aa34.64■■■■□ 3.14
ILF3-216ENST00000589600 AKAP12Q02952 1782 aa34.62■■■■□ 3.13
ILF3-216ENST00000589600 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
ILF3-216ENST00000589600 SLC24A1O60721 1099 aa34.58■■■■□ 3.13
ILF3-216ENST00000589600 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
ILF3-216ENST00000589600 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
ILF3-216ENST00000589600 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.57■■■■□ 3.12
ILF3-216ENST00000589600 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
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ILF3-216ENST00000589600 TMF1P82094 1093 aa34.55■■■■□ 3.12
ILF3-216ENST00000589600 USP6P35125 1406 aa34.55■■■■□ 3.12
ILF3-216ENST00000589600 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.54■■■■□ 3.12
ILF3-216ENST00000589600 SSH2Q76I76 1423 aa34.54■■■■□ 3.12
ILF3-216ENST00000589600 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.53■■■■□ 3.12
ILF3-216ENST00000589600 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.53■■■■□ 3.12
ILF3-216ENST00000589600 ARHGEF10O15013 1369 aa34.53■■■■□ 3.12
ILF3-216ENST00000589600 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
ILF3-216ENST00000589600 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
ILF3-216ENST00000589600 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
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