RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 PHLPP1O60346 1717 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 PRAM1Q96QH2 718 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGRB2O60241 1585 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-205ENST00000558534 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-205ENST00000558534 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-205ENST00000558534 BRINP3Q76B58 766 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-205ENST00000558534 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF1AQ12756 1690 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-205ENST00000558534 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-205ENST00000558534 JCADQ9P266 1359 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 SHPRHQ149N8 1683 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 ITSN1Q15811 1721 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-205ENST00000558534 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ORAI2Q96SN7 254 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 NUTM2FA1L443 756 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC24A1O60721 1099 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PSME1Q06323 249 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 USP32Q8NFA0 1604 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 EVC2Q86UK5 1308 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 FOXO3O43524 673 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 CDK19Q9BWU1 502 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PXDNQ92626 1479 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP7BP35670 1465 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-205ENST00000558534 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 SBNO1A3KN83 1393 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF10O15013 1369 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.27■■□□□ 1.16
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 LRP6O75581 1613 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CABP2Q9NPB3 220 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-205ENST00000558534 USP47Q96K76 1375 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 ALS2Q96Q42 1657 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 ACEP12821 1306 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 CDCA8Q53HL2 280 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-205ENST00000558534 TMF1P82094 1093 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 AKAP12Q02952 1782 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-205ENST00000558534 CABP1Q9NZU7 370 aa22.13■■□□□ 1.13
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