RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 SHPRHQ149N8 1683 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD8-204ENST00000544999 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD8-204ENST00000544999 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD8-204ENST00000544999 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRB1O14514 1584 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD8-204ENST00000544999 DLC1Q96QB1 1528 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD8-204ENST00000544999 ORAI2Q96SN7 254 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD8-204ENST00000544999 SOCS7O14512 581 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-204ENST00000544999 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-204ENST00000544999 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD8-204ENST00000544999 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-204ENST00000544999 LRP6O75581 1613 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-204ENST00000544999 PRAM1Q96QH2 718 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD8-204ENST00000544999 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD8-204ENST00000544999 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 POGKQ9P215 609 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 NUTM2FA1L443 756 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRB2O60241 1585 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 KIF1AQ12756 1690 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 POTEAQ6S8J7 498 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 PXDNQ92626 1479 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 FOXO3O43524 673 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD8-204ENST00000544999 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 USP32Q8NFA0 1604 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 NEUROD1Q13562 356 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-204ENST00000544999 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 AFF2P51816 1311 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 C8orf37Q96NL8 207 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 PSME1Q06323 249 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 ADAMTS2O95450 1211 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 SBNO1A3KN83 1393 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD8-204ENST00000544999 ITSN1Q15811 1721 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 NGLY1Q96IV0 654 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 ATP7BP35670 1465 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 RXRBP28702 533 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 CDK19Q9BWU1 502 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 MSH5O43196 834 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGEF10O15013 1369 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD8-204ENST00000544999 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 USP21Q9UK80 565 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 TONSLQ96HA7 1378 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 ALS2Q96Q42 1657 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 ABCA3Q99758 1704 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD8-204ENST00000544999 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 ATRNO75882 1429 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 ADRA2BP18089 450 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD8-204ENST00000544999 SLIT2O94813 1529 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms