RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STK26Q9P289 416 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SHPRHQ149N8 1683 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BRINP3Q76B58 766 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF1AQ12756 1690 aa23.41■■□□□ 1.34
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.39■■□□□ 1.33
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP32Q8NFA0 1604 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEUROD1Q13562 356 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.33■■□□□ 1.33
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.31■■□□□ 1.32
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.29■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.29■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.29■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PXDNQ92626 1479 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TONSLQ96HA7 1378 aa23.27■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRP6O75581 1613 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUTM2FA1L443 756 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP7BP35670 1465 aa23.19■■□□□ 1.3
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.11■■□□□ 1.29
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.08■■□□□ 1.28
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.05■■□□□ 1.28
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.05■■□□□ 1.28
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 AKAP12Q02952 1782 aa23■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EVC2Q86UK5 1308 aa23■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.99■■□□□ 1.27
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POTEAQ6S8J7 498 aa22.96■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AFF2P51816 1311 aa22.96■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.96■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C8orf37Q96NL8 207 aa22.95■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CABP2Q9NPB3 220 aa22.95■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACEP12821 1306 aa22.94■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.93■■□□□ 1.26
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.93■■□□□ 1.26
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