RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 ADGRB1O14514 1584 aa34.95■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.92■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 PRAM1Q96QH2 718 aa34.91■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.88■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.87■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.87■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.87■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 NEUROD1Q13562 356 aa34.86■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.84■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.84■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.84■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
PITX3-202ENST00000539804 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.81■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 ORAI2Q96SN7 254 aa34.8■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 SHPRHQ149N8 1683 aa34.79■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.78■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.77■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 ADGRB2O60241 1585 aa34.77■■■■□ 3.16
PITX3-202ENST00000539804 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
PITX3-202ENST00000539804 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX3-202ENST00000539804 TONSLQ96HA7 1378 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX3-202ENST00000539804 KIF1AQ12756 1690 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2FA1L443 756 aa34.69■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.66■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 FOXO3O43524 673 aa34.65■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.65■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 PSME1Q06323 249 aa34.64■■■■□ 3.14
PITX3-202ENST00000539804 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.62■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.61■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.6■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.59■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 PXDNQ92626 1479 aa34.58■■■■□ 3.13
PITX3-202ENST00000539804 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.57■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 ILDR2Q71H61 639 aa34.55■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.54■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 LRP6O75581 1613 aa34.52■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.51■■■■□ 3.12
PITX3-202ENST00000539804 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 CDK19Q9BWU1 502 aa34.5■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.5■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 SBNO1A3KN83 1393 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 ITSN1Q15811 1721 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 USP32Q8NFA0 1604 aa34.48■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.48■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 ARHGEF10O15013 1369 aa34.46■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.45■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.45■■■■□ 3.11
PITX3-202ENST00000539804 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.44■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.44■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 SOCS7O14512 581 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 ATP7BP35670 1465 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 EVC2Q86UK5 1308 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.41■■■■□ 3.1
PITX3-202ENST00000539804 C8orf37Q96NL8 207 aa34.38■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 SLC24A1O60721 1099 aa34.37■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 NGLY1Q96IV0 654 aa34.37■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS2O95450 1211 aa34.36■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 AFF2P51816 1311 aa34.35■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.35■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.34■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 POTEAQ6S8J7 498 aa34.33■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.33■■■■□ 3.09
PITX3-202ENST00000539804 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.29■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 CABP2Q9NPB3 220 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 ACEP12821 1306 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 RXRBP28702 533 aa34.26■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
PITX3-202ENST00000539804 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
PITX3-202ENST00000539804 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.24■■■■□ 3.07
PITX3-202ENST00000539804 USP21Q9UK80 565 aa34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms