RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 HRCP23327 699 aa10.65□□□□□ -0.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM259Q4ZIN3 620 aa10.65□□□□□ -0.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.64□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 C6orf229H3BNL8 230 aa10.63□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTPN5P54829 565 aa10.63□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.63□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 BANK1Q8NDB2 785 aa10.63□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.62□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 RETREG3Q86VR2 466 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.61□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 C14orf37Q86TY3 774 aa10.6□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 HCSTQ9UBK5 93 aa10.6□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
RNU6-334P-201ENST00000517072 BRICD5Q6PL45 260 aa10.58□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 SOCS7O14512 581 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 MCM6Q14566 821 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 THAP11Q96EK4 314 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 AP1G2O75843 785 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 COPS2P61201 443 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 DESI1Q6ICB0 168 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRR7Q8TB68 274 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 MTRQ99707 1265 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 CFAP99D6REC4 459 aa10.55□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 APBB1O00213 710 aa10.55□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 IL21Q9HBE4 155 aa10.55□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZPR1O75312 459 aa10.54□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 USP17L8P0C7I0 530 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 MSS51Q4VC12 460 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 TJAP1Q5JTD0 557 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPSB2Q99619 263 aa10.53□□□□□ -0.72
RNU6-334P-201ENST00000517072 TSC1Q92574 1164 aa10.52□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADH1BP00325 375 aa10.51□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 SNRKQ9NRH2 765 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 JUNDP17535 347 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 MMRN1Q13201 1228 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.48□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 TLL1O43897 1013 aa10.47□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 LYPD8Q6UX82 237 aa10.47□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 MMP16P51512 607 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTPRNQ16849 979 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF516Q92618 1163 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZMYND15Q9H091 742 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAD21O60216 631 aa10.45□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNC4Q03721 635 aa10.45□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 A6NJR5 290 aa10.43□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.43□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.43□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.42□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.41□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.4□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 PNMA1Q8ND90 353 aa10.4□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 COG6Q9Y2V7 657 aa10.4□□□□□ -0.74
RNU6-334P-201ENST00000517072 WWC1Q8IX03 1113 aa10.39□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.39□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.39□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.38□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.38□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 S1PR4O95977 384 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 GGCXP38435 758 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 POM121Q96HA1 1249 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.36□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.36□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 NR6A1Q15406 480 aa10.35□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 IFFO2Q5TF58 517 aa10.35□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 CTHP32929 405 aa10.34□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNH2Q12809 1159 aa10.34□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.34□□□□□ -0.75
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAP10Q9P2G4 905 aa10.33□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABL2P42684 1182 aa10.32□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.32□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAK2O60296 914 aa10.31□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.31□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 FKBPLQ9UIM3 349 aa10.31□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms