RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ADGRB1O14514 1584 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 DIP2BQ9P265 1576 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 MYOM1P52179 1685 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CDK19Q9BWU1 502 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 SLFN5Q08AF3 891 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 E9PSI1 815 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 RUNDC1Q96C34 613 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.4□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 15.1
RABGEF1-208ENST00000510829 CABP1Q9NZU7 370 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PIK3C2BO00750 1634 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ZFYVE9O95405 1425 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NGEFQ8N5V2 710 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PP64 1363 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF521Q96K83 1311 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 WWC1Q8IX03 1113 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ZMYM3Q14202 1370 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 BCAR3O75815 825 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NSD2O96028 1365 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 FYB1O15117 783 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.33□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NEFMP07197 916 aa14.33□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.33□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.33□□□□□ -0.11
RABGEF1-208ENST00000510829 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 AGLP35573 1532 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 NUTM2FA1L443 756 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 ALKQ9UM73 1620 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TNRQ92752 1358 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 MYT1Q01538 1121 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCC11Q96J66 1382 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 PTPRMP28827 1452 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 FBLN1P23142 703 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 MSH5O43196 834 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 SKAP1Q86WV1 359 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 WDR63Q8IWG1 891 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-208ENST00000510829 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 EID1Q9Y6B2 187 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 COG6Q9Y2V7 657 aa14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 METP08581 1390 aa14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 PANK1Q8TE04 598 aa14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 RGS3P49796 1198 aa14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 PDE4AP27815 886 aa14.25□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.25□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.25□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 RIPK4P57078 832 aa14.25□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.25□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 REREQ9P2R6 1566 aa14.24□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 NME9Q86XW9 330 aa14.24□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
RABGEF1-208ENST00000510829 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
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