RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXD11-202ENST00000498438 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXD11-202ENST00000498438 SIRT1Q96EB6 747 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD11-202ENST00000498438 ORAI2Q96SN7 254 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD11-202ENST00000498438 DLC1Q96QB1 1528 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD11-202ENST00000498438 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.76■■□□□ 1.87
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HOXD11-202ENST00000498438 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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HOXD11-202ENST00000498438 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXD11-202ENST00000498438 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
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HOXD11-202ENST00000498438 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXD11-202ENST00000498438 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXD11-202ENST00000498438 NGLY1Q96IV0 654 aa26.39■■□□□ 1.82
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HOXD11-202ENST00000498438 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD11-202ENST00000498438 TONSLQ96HA7 1378 aa26.38■■□□□ 1.81
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HOXD11-202ENST00000498438 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
HOXD11-202ENST00000498438 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD11-202ENST00000498438 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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HOXD11-202ENST00000498438 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD11-202ENST00000498438 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD11-202ENST00000498438 ATRNO75882 1429 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD11-202ENST00000498438 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD11-202ENST00000498438 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD11-202ENST00000498438 ACEP12821 1306 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD11-202ENST00000498438 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.23■■□□□ 1.79
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